More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1029 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  100 
 
 
486 aa  985    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  48.69 
 
 
540 aa  472  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  40.67 
 
 
494 aa  350  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 
551 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  37.17 
 
 
553 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
551 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
551 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
551 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
553 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
551 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 
551 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 
553 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 
549 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.43 
 
 
553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  33.65 
 
 
581 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.68 
 
 
531 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.66 
 
 
534 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.68 
 
 
540 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.86 
 
 
518 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  32.88 
 
 
530 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.25 
 
 
564 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  29.89 
 
 
557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.87 
 
 
535 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  28.2 
 
 
605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.85 
 
 
469 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.96 
 
 
501 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.05 
 
 
537 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.29 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.24 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  33.41 
 
 
451 aa  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.1 
 
 
550 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 
491 aa  189  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.38 
 
 
509 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
502 aa  186  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  29.75 
 
 
510 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  33.13 
 
 
512 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.13 
 
 
530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.21 
 
 
497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.55 
 
 
526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.3 
 
 
541 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30 
 
 
571 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  33.54 
 
 
497 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  33.06 
 
 
960 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  30.92 
 
 
449 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.41 
 
 
481 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  34.97 
 
 
491 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  31.69 
 
 
477 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.02 
 
 
576 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.08 
 
 
493 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.77 
 
 
585 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.14 
 
 
495 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  25.32 
 
 
463 aa  177  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.05 
 
 
458 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  31.1 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
770 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.32 
 
 
569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  31.81 
 
 
568 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.32 
 
 
569 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
474 aa  172  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  33.19 
 
 
516 aa  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 
489 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.38 
 
 
512 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.26 
 
 
493 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.67 
 
 
528 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  32.77 
 
 
764 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.8 
 
 
548 aa  170  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
571 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
541 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  32.07 
 
 
492 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  33.33 
 
 
408 aa  168  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  28.98 
 
 
574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.37 
 
 
471 aa  167  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.62 
 
 
568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  28.71 
 
 
581 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.93 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  31.3 
 
 
488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  31.3 
 
 
488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  26.37 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.55 
 
 
811 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
481 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
568 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  24.37 
 
 
574 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  25.29 
 
 
566 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  27.23 
 
 
647 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  31.42 
 
 
517 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
470 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  31.61 
 
 
514 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  28.29 
 
 
490 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  26.86 
 
 
568 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  31.57 
 
 
488 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  31.63 
 
 
966 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  27.94 
 
 
501 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.91 
 
 
498 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.44 
 
 
464 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  30.11 
 
 
491 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.63 
 
 
479 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.31 
 
 
566 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  29.85 
 
 
490 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.8 
 
 
810 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>