More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
656 aa  1222    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  29.86 
 
 
895 aa  254  5.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  42.73 
 
 
488 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  42.73 
 
 
488 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  42.57 
 
 
488 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  38.01 
 
 
491 aa  236  7e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
482 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  40.39 
 
 
517 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  38.62 
 
 
539 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  40.81 
 
 
492 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  45.48 
 
 
494 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  41.61 
 
 
512 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  30.44 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.09 
 
 
605 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
541 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
484 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  44.17 
 
 
475 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  42.51 
 
 
475 aa  190  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.77 
 
 
564 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  29.29 
 
 
466 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  29.29 
 
 
466 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.47 
 
 
467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  32.17 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.32 
 
 
557 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  34.37 
 
 
458 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  36.7 
 
 
526 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.37 
 
 
764 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29 
 
 
810 aa  177  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.63 
 
 
531 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.88 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.9 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  34.78 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.85 
 
 
534 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.51 
 
 
495 aa  171  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  32.5 
 
 
456 aa  171  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 
551 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.83 
 
 
571 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.04 
 
 
593 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 
566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.65 
 
 
566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.84 
 
 
500 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.5 
 
 
568 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.26 
 
 
530 aa  164  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.24 
 
 
493 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  33.92 
 
 
497 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.73 
 
 
568 aa  163  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.25 
 
 
553 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.47 
 
 
574 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.84 
 
 
512 aa  161  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  33.33 
 
 
574 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
470 aa  160  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.91 
 
 
548 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.59 
 
 
490 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  28.54 
 
 
497 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  30.3 
 
 
494 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.02 
 
 
566 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  28.45 
 
 
553 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 
566 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  28.45 
 
 
551 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.62 
 
 
471 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 
566 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.33 
 
 
551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.88 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  28.64 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.33 
 
 
498 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.72 
 
 
1091 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 
551 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 
553 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.75 
 
 
593 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.9 
 
 
566 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
489 aa  154  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.26 
 
 
628 aa  154  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.85 
 
 
571 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.78 
 
 
479 aa  153  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  33.49 
 
 
528 aa  153  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  31.75 
 
 
482 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.41 
 
 
558 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  33.18 
 
 
449 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  31.88 
 
 
477 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.62 
 
 
530 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  34.3 
 
 
486 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 
558 aa  152  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  24.06 
 
 
568 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.96 
 
 
464 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  29.55 
 
 
478 aa  151  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  23.64 
 
 
568 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 
481 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
551 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.33 
 
 
510 aa  150  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.42 
 
 
579 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  28.36 
 
 
587 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
474 aa  148  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 
502 aa  148  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  32.69 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.83 
 
 
541 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  31.89 
 
 
490 aa  148  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  29.82 
 
 
493 aa  148  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  26.61 
 
 
569 aa  147  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.65 
 
 
450 aa  147  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  33.79 
 
 
514 aa  146  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>