More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1490 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  100 
 
 
408 aa  781    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.21 
 
 
531 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34.34 
 
 
510 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.01 
 
 
553 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  30.49 
 
 
483 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.25 
 
 
534 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.98 
 
 
464 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  35.27 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.81 
 
 
501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  30.93 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.07 
 
 
541 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.38 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.99 
 
 
535 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.84 
 
 
526 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.81 
 
 
495 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.26 
 
 
469 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  31.15 
 
 
491 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.85 
 
 
530 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.33 
 
 
486 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  29.21 
 
 
466 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  29.21 
 
 
466 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.21 
 
 
518 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
551 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  30.7 
 
 
540 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.01 
 
 
456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 
491 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  26.78 
 
 
467 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.17 
 
 
512 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.06 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.84 
 
 
553 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.65 
 
 
558 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.65 
 
 
540 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  28.24 
 
 
494 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  31.38 
 
 
451 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 
474 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  31.16 
 
 
449 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  31.9 
 
 
764 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.33 
 
 
517 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  31.08 
 
 
574 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.46 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.57 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  30.57 
 
 
451 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 
551 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.83 
 
 
497 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  30.94 
 
 
490 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.53 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  30.52 
 
 
543 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  29.44 
 
 
539 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  24.64 
 
 
568 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31 
 
 
458 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.15 
 
 
548 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.5 
 
 
530 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 
551 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 
551 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  32.24 
 
 
488 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.84 
 
 
568 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.77 
 
 
493 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  32.24 
 
 
488 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  32.68 
 
 
488 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  32.58 
 
 
966 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  29.26 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  32.11 
 
 
960 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  30.37 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 
553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 
551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  31.17 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.25 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1338  ABC transporter related  29.62 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0193061  normal  0.712297 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  27.9 
 
 
647 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  26.29 
 
 
568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.07 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  32.44 
 
 
675 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  29.42 
 
 
454 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.79 
 
 
491 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  30.51 
 
 
455 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  24.15 
 
 
502 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.51 
 
 
479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.74 
 
 
558 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.29 
 
 
537 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 
566 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.16 
 
 
553 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.87 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  30.2 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  29.53 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.82 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  30.23 
 
 
516 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  28.99 
 
 
456 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.45 
 
 
478 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.74 
 
 
550 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  29.16 
 
 
536 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  24.29 
 
 
558 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  30.02 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  27.35 
 
 
569 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  30.64 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  27.35 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  29.31 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  30.79 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 
551 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.57 
 
 
547 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>