More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4851 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  62.66 
 
 
558 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  64.3 
 
 
547 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  61.7 
 
 
565 aa  648    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  60.94 
 
 
557 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  66.42 
 
 
563 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
546 aa  1069    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  63.02 
 
 
561 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  65.42 
 
 
546 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  60.11 
 
 
536 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  57.51 
 
 
583 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  55.97 
 
 
575 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  52.22 
 
 
551 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  49.81 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  48.87 
 
 
619 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  48.46 
 
 
573 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.24 
 
 
661 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  47.82 
 
 
571 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  50.81 
 
 
565 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  49.46 
 
 
597 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.1 
 
 
643 aa  478  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
594 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 
572 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.91 
 
 
548 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
573 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.71 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.86 
 
 
584 aa  468  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  47.07 
 
 
588 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  49.25 
 
 
539 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  48.67 
 
 
597 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.51 
 
 
548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  49.91 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  50.09 
 
 
545 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  50 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  47.12 
 
 
592 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  48.78 
 
 
528 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.6 
 
 
609 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.9 
 
 
562 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  46.25 
 
 
541 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.58 
 
 
586 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  44.97 
 
 
576 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.29 
 
 
590 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.61 
 
 
599 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
607 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  48.58 
 
 
547 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  45.31 
 
 
600 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.01 
 
 
549 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.96 
 
 
616 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.49 
 
 
549 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  46.52 
 
 
585 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  44.8 
 
 
586 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  46.43 
 
 
534 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
540 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  43.41 
 
 
571 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  46.12 
 
 
592 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.31 
 
 
592 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
563 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  42.83 
 
 
540 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  47.74 
 
 
538 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.63 
 
 
606 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.23 
 
 
534 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  43.9 
 
 
564 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.74 
 
 
568 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  44.63 
 
 
542 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.44 
 
 
564 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
554 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  41.79 
 
 
588 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
539 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  45.9 
 
 
603 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.91 
 
 
617 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  44.57 
 
 
534 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  41.81 
 
 
522 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  44.44 
 
 
606 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 
548 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  45.25 
 
 
550 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  43.46 
 
 
545 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.53 
 
 
575 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  43.03 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  42.61 
 
 
631 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.24 
 
 
548 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.11 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.75 
 
 
593 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  45.01 
 
 
557 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  44.81 
 
 
553 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  43.41 
 
 
538 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  43.6 
 
 
546 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  45.72 
 
 
552 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  46.46 
 
 
550 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  45.34 
 
 
557 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  42.32 
 
 
609 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  45.11 
 
 
534 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
536 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
536 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.56 
 
 
546 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  43.37 
 
 
525 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  44.99 
 
 
537 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.75 
 
 
539 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  44.63 
 
 
557 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.18 
 
 
571 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  43.34 
 
 
541 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
543 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>