More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1420 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  100 
 
 		 553 aa  1092    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 540 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  34.87 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  35.03 
 
 		 543 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  32.81 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.55 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.28 
 
 		 547 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.63 
 
 		 580 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.74 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  28.46 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.06 
 
 		 534 aa  199  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  25.79 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  26.16 
 
 		 557 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.83 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  27.09 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  25.93 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  25.68 
 
 		 605 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  25.42 
 
 		 518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.9 
 
 		 810 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  26.97 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.47 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  24.9 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.96 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.48 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  26.73 
 
 		 483 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  25.48 
 
 		 553 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  26.06 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.16 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  25.29 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  25.24 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.14 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  25.24 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26.13 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  25.38 
 
 		 551 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 551 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.19 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  25.17 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.24 
 
 		 770 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  23.85 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  25.53 
 
 		 469 aa  144  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  24.41 
 
 		 593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.84 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  27.19 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  26.45 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  23.69 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  26.54 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  24.21 
 
 		 568 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  27.15 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  25.44 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  24.75 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.22 
 
 		 550 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  27.6 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  24.33 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  23.01 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  25.28 
 
 		 576 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.32 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  24.4 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  22.57 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  26.76 
 
 		 571 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  24.89 
 
 		 482 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.15 
 
 		 501 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  23.25 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  23.4 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  23.79 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  22.74 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  26.34 
 
 		 628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  28.22 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  28.34 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  23.02 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  26.36 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  22.65 
 
 		 571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  27.04 
 
 		 574 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  33.33 
 
 		 966 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  25.84 
 
 		 556 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.95 
 
 		 495 aa  129  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.04 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  21.88 
 
 		 630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  26.89 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  24.41 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.07 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  22.77 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  22.83 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  25.98 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  26.46 
 
 		 541 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.15 
 
 		 558 aa  127  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 491 aa  126  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  28.87 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  26.46 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  24.47 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  22.89 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  24.47 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  25.09 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  26.95 
 
 		 581 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  24.44 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>