More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  100 
 
 		 350 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  57.6 
 
 		 282 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  61.33 
 
 		 302 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  50.36 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  49.06 
 
 		 271 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  52.14 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  50.81 
 
 		 271 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  41.9 
 
 		 265 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  50.39 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  46.64 
 
 		 271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  44.53 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  45.62 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  41.98 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.25 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  45.72 
 
 		 313 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 		 290 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  45.97 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.47 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.62 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  43.62 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 286 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 286 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  45.49 
 
 		 273 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  45.56 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  45.56 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  45.56 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  45.04 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  44.66 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  45.56 
 
 		 296 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  42.34 
 
 		 257 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  42.34 
 
 		 257 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  42.34 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  46.4 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  35.63 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  30.71 
 
 		 259 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.47 
 
 		 256 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 254 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  33.59 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  34.33 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.8 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.85 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  33.97 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  35.83 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 		 257 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  36.44 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.56 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.93 
 
 		 249 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  29.54 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.92 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  38.27 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  29.02 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  35.1 
 
 		 250 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  28.74 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  27.38 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  31.12 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  31.28 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  36.05 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  32.26 
 
 		 248 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  34.6 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  34.86 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  36.55 
 
 		 278 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  39.82 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  35.77 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  38.22 
 
 		 244 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  32.93 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 		 249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.49 
 
 		 268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.58 
 
 		 258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  36.1 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  35.68 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  30.37 
 
 		 253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  34 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  35.12 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  34.75 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  30.37 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  37.33 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.33 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  34.43 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  35.92 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 254 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>