16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1219 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  100 
 
 
378 aa  786    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  79.58 
 
 
390 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  71.47 
 
 
366 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  62.4 
 
 
377 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  59.9 
 
 
392 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  59.9 
 
 
392 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  58.09 
 
 
401 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  57.59 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  55.56 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  33.33 
 
 
401 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  33.81 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  30.46 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  32.68 
 
 
292 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  43.01 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  31.65 
 
 
765 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  29.41 
 
 
810 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>