More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0157 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  100 
 
 		 675 aa  1290    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  47.31 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  47.4 
 
 		 682 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  47.4 
 
 		 682 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  47.26 
 
 		 709 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 697 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 681 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 944 aa  326  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.39 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  32.35 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  35.36 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.27 
 
 		 571 aa  200  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 770 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.42 
 
 		 647 aa  196  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.87 
 
 		 568 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.2 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.86 
 
 		 576 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.1 
 
 		 568 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.11 
 
 		 557 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 482 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.36 
 
 		 469 aa  177  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.93 
 
 		 458 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.69 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.11 
 
 		 495 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.29 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.02 
 
 		 573 aa  171  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  32.93 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  30.63 
 
 		 555 aa  168  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 516 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.04 
 
 		 558 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  32.84 
 
 		 478 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.19 
 
 		 509 aa  163  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.58 
 
 		 481 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  27.48 
 
 		 593 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  33.2 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  32.6 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.82 
 
 		 581 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  33.13 
 
 		 540 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  34.15 
 
 		 552 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  32.37 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  34.18 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  33.26 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  31.11 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  32.86 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  33.73 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.77 
 
 		 548 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.33 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  31.79 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  33.07 
 
 		 585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  30.74 
 
 		 588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.41 
 
 		 543 aa  157  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.85 
 
 		 464 aa  157  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  30.77 
 
 		 541 aa  156  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  32.73 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  31.86 
 
 		 561 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.6 
 
 		 568 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  31.85 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  32.37 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  33.94 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.31 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  32.88 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  30.43 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  33.06 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  33.14 
 
 		 565 aa  156  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 568 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  28.86 
 
 		 531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  31.59 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  32.42 
 
 		 545 aa  154  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 536 aa  153  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  30.83 
 
 		 491 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.6 
 
 		 501 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  31.45 
 
 		 557 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 406 aa  152  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  31.38 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  29.38 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  33.11 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  29.13 
 
 		 613 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  33.27 
 
 		 549 aa  152  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  31.5 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  31.81 
 
 		 539 aa  152  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  32.27 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.98 
 
 		 530 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  34.58 
 
 		 542 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  31.64 
 
 		 533 aa  151  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  31.55 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  32.18 
 
 		 569 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  32.21 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.97 
 
 		 477 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  46.3 
 
 		 273 aa  150  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  32.33 
 
 		 544 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  32.57 
 
 		 534 aa  150  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  31.5 
 
 		 665 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  33.13 
 
 		 563 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  32.34 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>