More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3657 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1060    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  83.58 
 
 		 534 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  73 
 
 		 534 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  70.75 
 
 		 538 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  89.83 
 
 		 538 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  62.12 
 
 		 539 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  68.54 
 
 		 544 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  72.73 
 
 		 534 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  63.84 
 
 		 585 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  60.19 
 
 		 545 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  61.02 
 
 		 552 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  60.26 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  58.96 
 
 		 558 aa  608  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  57.17 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  60.26 
 
 		 557 aa  598  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  60.3 
 
 		 545 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  60.64 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  60.99 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  58.46 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  59.25 
 
 		 560 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  57.22 
 
 		 541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  62.29 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  57.36 
 
 		 552 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  57.25 
 
 		 550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  58.16 
 
 		 553 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  57.28 
 
 		 552 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 548 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  57.86 
 
 		 552 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  57.41 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  56.69 
 
 		 552 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  53.1 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  54.61 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  51.76 
 
 		 546 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  52.54 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  50.57 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  51.36 
 
 		 612 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  52.35 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  51.71 
 
 		 615 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.18 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  50.88 
 
 		 624 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  52.81 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.01 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 539 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  52.8 
 
 		 613 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  49.73 
 
 		 609 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  51.06 
 
 		 624 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  51.24 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  48.44 
 
 		 546 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  49.46 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  48.47 
 
 		 611 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.73 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  50.9 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.88 
 
 		 626 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  48.11 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  47.39 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  43.65 
 
 		 564 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.28 
 
 		 610 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  47.04 
 
 		 640 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 		 633 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 601 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  50.66 
 
 		 547 aa  465  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 		 623 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  48.35 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  45.28 
 
 		 619 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  51.26 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  47.15 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.31 
 
 		 612 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  48.31 
 
 		 612 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  45.73 
 
 		 631 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 632 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  49.34 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  47.79 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  49.53 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.16 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.33 
 
 		 640 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  50.47 
 
 		 586 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  49.54 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  44.33 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  47.33 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  48.07 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  45.55 
 
 		 629 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  47.83 
 
 		 597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 		 625 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  44.98 
 
 		 547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.68 
 
 		 531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.6 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  48.2 
 
 		 544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 627 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.28 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>