More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3431 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  100 
 
 		 682 aa  1342    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  99.71 
 
 		 682 aa  1340    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  76.83 
 
 		 709 aa  971    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  100 
 
 		 682 aa  1342    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  77.86 
 
 		 681 aa  973    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 697 aa  886    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 675 aa  492  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 944 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.31 
 
 		 810 aa  184  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.22 
 
 		 458 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.88 
 
 		 568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.39 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 770 aa  158  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  29.17 
 
 		 555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  30.62 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.72 
 
 		 647 aa  147  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.4 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.29 
 
 		 541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  30.59 
 
 		 546 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  28.76 
 
 		 557 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  30.24 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  29.66 
 
 		 561 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  29.78 
 
 		 628 aa  140  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  29.64 
 
 		 764 aa  140  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.25 
 
 		 553 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  28.74 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  29.61 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  30.18 
 
 		 624 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  28.57 
 
 		 540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  30.18 
 
 		 624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  29.64 
 
 		 624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.12 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  28.94 
 
 		 544 aa  138  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  31.11 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.44 
 
 		 509 aa  138  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 530 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  27.5 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  30.38 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  30.14 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  28.22 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  29.17 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  28.94 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  30.06 
 
 		 608 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  31.87 
 
 		 545 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  29.12 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  31.29 
 
 		 538 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  27.2 
 
 		 536 aa  133  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 541 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  27.44 
 
 		 543 aa  133  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.14 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  29.3 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  29.53 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  29.33 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.4 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  30.31 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  27.31 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  30.18 
 
 		 536 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  30.06 
 
 		 531 aa  132  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  28.03 
 
 		 534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  29.11 
 
 		 614 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  28.06 
 
 		 546 aa  131  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 		 536 aa  131  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  31.3 
 
 		 548 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  29.64 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  30.77 
 
 		 582 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25.77 
 
 		 593 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.59 
 
 		 566 aa  130  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  27.9 
 
 		 532 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.83 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.1 
 
 		 490 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  27.76 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  27.95 
 
 		 565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.69 
 
 		 477 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  31.62 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  29.75 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  27.19 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 		 281 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.2 
 
 		 495 aa  129  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  31.19 
 
 		 532 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  29.55 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  28.21 
 
 		 534 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  28.72 
 
 		 613 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  28.46 
 
 		 530 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  27.9 
 
 		 538 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  27.98 
 
 		 559 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  28.81 
 
 		 665 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  27.03 
 
 		 557 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 293 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 293 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 293 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  28.06 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 293 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  31.08 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.28 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  28.93 
 
 		 565 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>