More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1029 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1105    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  38.93 
 
 		 585 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  39.07 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  37.52 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  38.31 
 
 		 550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  35.5 
 
 		 562 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  38.42 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  36.61 
 
 		 538 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 547 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  36.4 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  36.76 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 544 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  37.09 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  37.91 
 
 		 536 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  35.86 
 
 		 550 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  38.25 
 
 		 534 aa  306  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  38.88 
 
 		 592 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  38.68 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  36.85 
 
 		 552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  35.1 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  35.61 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  37.12 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  35.82 
 
 		 538 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  34.63 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  36.45 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.12 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  35.98 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  35.98 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  35.98 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  36.78 
 
 		 624 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  36.13 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 546 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  36.35 
 
 		 600 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  38.32 
 
 		 530 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  36.68 
 
 		 552 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  36.6 
 
 		 540 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  36.38 
 
 		 624 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1324  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  36.81 
 
 		 517 aa  299  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000609088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  36.83 
 
 		 615 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  34.98 
 
 		 550 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  37.59 
 
 		 549 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.95 
 
 		 563 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  33.86 
 
 		 612 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  34.17 
 
 		 554 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  37.87 
 
 		 527 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  37.5 
 
 		 613 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  34.63 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  37 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 594 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  35.4 
 
 		 544 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  36.33 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  35.99 
 
 		 546 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  34.95 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  35.32 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  37.59 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  36.49 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  36.88 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  36.61 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  33.15 
 
 		 546 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  34.25 
 
 		 611 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.93 
 
 		 548 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  34 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 573 aa  290  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  34.31 
 
 		 540 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  36.26 
 
 		 552 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  34.86 
 
 		 640 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  36.14 
 
 		 575 aa  290  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  34.46 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  35.3 
 
 		 546 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  36.13 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  34.76 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  36.04 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.85 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  35.67 
 
 		 566 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  36.95 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.99 
 
 		 531 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.88 
 
 		 584 aa  286  5.999999999999999e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  37.69 
 
 		 559 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.27 
 
 		 643 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  36.99 
 
 		 543 aa  286  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  36.65 
 
 		 537 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  35.13 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.87 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.27 
 
 		 626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.38 
 
 		 590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  33.45 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  34.23 
 
 		 609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 		 545 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  37.36 
 
 		 607 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.36 
 
 		 549 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  37.69 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  34.61 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  37.69 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  36.88 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  35.19 
 
 		 546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>