More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3317 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  62.45 
 
 
560 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  100 
 
 
545 aa  1096    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  59.7 
 
 
545 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  58.29 
 
 
540 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  60.19 
 
 
540 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.96 
 
 
540 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  58.76 
 
 
544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  58.77 
 
 
546 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  60.26 
 
 
534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  59.62 
 
 
538 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  56.24 
 
 
541 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  57.3 
 
 
539 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  58.49 
 
 
534 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 
547 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  59.43 
 
 
534 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  56.77 
 
 
557 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  56.64 
 
 
538 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  54.8 
 
 
558 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  55.64 
 
 
553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  55.08 
 
 
550 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  56.71 
 
 
554 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  56.71 
 
 
552 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  56.51 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  57.59 
 
 
585 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  55.16 
 
 
552 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  54.14 
 
 
557 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  53.75 
 
 
552 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  54.78 
 
 
552 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.06 
 
 
548 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  51.21 
 
 
549 aa  558  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  53.38 
 
 
552 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  54.17 
 
 
556 aa  554  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.2 
 
 
552 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  55.92 
 
 
549 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  50.83 
 
 
556 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  50.66 
 
 
532 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  50.36 
 
 
612 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  49.81 
 
 
542 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.09 
 
 
546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  49.82 
 
 
615 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  47.57 
 
 
610 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.75 
 
 
609 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.94 
 
 
611 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  50 
 
 
613 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
543 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
601 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  47.75 
 
 
611 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  48.65 
 
 
611 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.11 
 
 
617 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  47.71 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  49.34 
 
 
592 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.57 
 
 
626 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  48.87 
 
 
592 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
539 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  48.68 
 
 
592 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  50 
 
 
568 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.32 
 
 
549 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  48.19 
 
 
611 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.65 
 
 
542 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  46.7 
 
 
543 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
623 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
632 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
629 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.31 
 
 
612 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
623 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
541 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.54 
 
 
542 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.31 
 
 
612 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  48.82 
 
 
597 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.07 
 
 
623 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  47.07 
 
 
623 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  47.58 
 
 
530 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.23 
 
 
542 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  47.64 
 
 
545 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
609 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  49.82 
 
 
613 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  45.69 
 
 
583 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.5 
 
 
553 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
539 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 
550 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.1 
 
 
640 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.45 
 
 
545 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.73 
 
 
633 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.92 
 
 
640 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.37 
 
 
633 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  46.04 
 
 
546 aa  475  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  48.4 
 
 
544 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.21 
 
 
619 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  46.1 
 
 
522 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.68 
 
 
606 aa  475  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.34 
 
 
596 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
545 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 
625 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.79 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  46.85 
 
 
547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.39 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>