More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4377 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  83.58 
 
 		 540 aa  846    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  71.4 
 
 		 534 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1057    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  71.67 
 
 		 538 aa  736    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  80.94 
 
 		 538 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  61.86 
 
 		 539 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  71.1 
 
 		 534 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  70 
 
 		 544 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  63.33 
 
 		 585 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  60.11 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  58.68 
 
 		 545 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  60.49 
 
 		 547 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  56.82 
 
 		 549 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  60.72 
 
 		 557 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  58.16 
 
 		 554 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  59.06 
 
 		 552 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  61.01 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  60.19 
 
 		 560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  62.1 
 
 		 549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  58.19 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  57.41 
 
 		 541 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  58.44 
 
 		 545 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  57.33 
 
 		 540 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  55.74 
 
 		 552 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  57.39 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  55.7 
 
 		 552 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  54.6 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.21 
 
 		 548 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  54.99 
 
 		 553 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  51.89 
 
 		 532 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  54.24 
 
 		 552 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  54.78 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  54.24 
 
 		 552 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.28 
 
 		 552 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  52.27 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  51.78 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  52.9 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.38 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  52.27 
 
 		 556 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  48.11 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  50.7 
 
 		 624 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  52.53 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  48.47 
 
 		 612 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  48.57 
 
 		 609 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  50.72 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.21 
 
 		 617 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  50.18 
 
 		 624 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  48.22 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.38 
 
 		 611 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  47.19 
 
 		 575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  47.07 
 
 		 629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.18 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  48.83 
 
 		 615 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  47.39 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.98 
 
 		 547 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  46.71 
 
 		 631 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  46.52 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.91 
 
 		 619 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  49.27 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  43.81 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.85 
 
 		 640 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  50.57 
 
 		 586 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  44.5 
 
 		 583 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  48.86 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.07 
 
 		 547 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.16 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.86 
 
 		 539 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.68 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.08 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  51.25 
 
 		 613 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  48.16 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  48.5 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.94 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 632 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 		 629 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.97 
 
 		 624 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.58 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  49.06 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.94 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.84 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.42 
 
 		 625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  47.1 
 
 		 599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  49.71 
 
 		 592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.84 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  47.64 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  49.32 
 
 		 592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  49.24 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  49.9 
 
 		 592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.65 
 
 		 633 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.78 
 
 		 633 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.21 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.38 
 
 		 596 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>