More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4251 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  61.94 
 
 		 549 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  71.64 
 
 		 557 aa  747    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  71.82 
 
 		 547 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  100 
 
 		 558 aa  1121    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  58.43 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  59.7 
 
 		 585 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  60.11 
 
 		 534 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  58 
 
 		 538 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  58.35 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  58.96 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  56.69 
 
 		 554 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  58.08 
 
 		 534 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  60.71 
 
 		 538 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  57.51 
 
 		 560 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  54.8 
 
 		 545 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  56.5 
 
 		 546 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 		 544 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  54.12 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  56.31 
 
 		 545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  55.18 
 
 		 539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  55.89 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  55.74 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  56.26 
 
 		 550 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  55.33 
 
 		 552 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.54 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.12 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  56.46 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  53.17 
 
 		 550 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  51.21 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  52.61 
 
 		 553 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  52.69 
 
 		 552 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  51.31 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  48.97 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  48.9 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  52.6 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  50.27 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  51.04 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  46.37 
 
 		 623 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  47.14 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  44.21 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  48.64 
 
 		 549 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  46.7 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.87 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.6 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  46.35 
 
 		 624 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.3 
 
 		 611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.79 
 
 		 547 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  46.51 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.37 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  46.42 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  47.87 
 
 		 556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.65 
 
 		 613 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.86 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.17 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.04 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.29 
 
 		 539 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.82 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.03 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  47.85 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.82 
 
 		 562 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.74 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  48.5 
 
 		 543 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  49.72 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.93 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  50.57 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  46.79 
 
 		 542 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.63 
 
 		 626 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.25 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.79 
 
 		 553 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  48.93 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 		 623 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  48.54 
 
 		 544 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.69 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  48.53 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  48.44 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.9 
 
 		 612 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  45.9 
 
 		 571 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 		 629 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  46.81 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.9 
 
 		 612 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  47.25 
 
 		 545 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.56 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.69 
 
 		 625 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.9 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  48.78 
 
 		 542 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 		 632 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 		 637 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>