More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1076 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  100 
 
 
546 aa  1080    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 
547 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  52.53 
 
 
585 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  53.88 
 
 
545 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  51.78 
 
 
538 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  52.83 
 
 
540 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  53.52 
 
 
546 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  51.76 
 
 
540 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  52.64 
 
 
553 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  52.43 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  50.09 
 
 
545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  52.82 
 
 
550 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  51.81 
 
 
534 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  53.31 
 
 
541 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.93 
 
 
548 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  49.81 
 
 
557 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  50.85 
 
 
532 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  48.9 
 
 
558 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
544 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  51.9 
 
 
534 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  50.75 
 
 
550 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  51.04 
 
 
538 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  52.16 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  51.59 
 
 
552 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  51.21 
 
 
552 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  50.94 
 
 
549 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  52.08 
 
 
560 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  51.04 
 
 
554 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  51.41 
 
 
552 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  48.11 
 
 
542 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  50.19 
 
 
552 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
540 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  50.38 
 
 
534 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  48.78 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  50.47 
 
 
549 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  50.66 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  47.05 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  49.17 
 
 
556 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.84 
 
 
626 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.47 
 
 
549 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.8 
 
 
612 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  48.6 
 
 
530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.68 
 
 
546 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
541 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.85 
 
 
617 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  47.94 
 
 
543 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.38 
 
 
542 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.09 
 
 
623 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
623 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.03 
 
 
542 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.02 
 
 
640 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.64 
 
 
576 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  47.75 
 
 
543 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.56 
 
 
640 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.46 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.75 
 
 
619 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  44.36 
 
 
545 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.97 
 
 
539 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.62 
 
 
539 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  44.92 
 
 
553 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  48.1 
 
 
547 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
540 aa  435  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
632 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 
625 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.51 
 
 
539 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.28 
 
 
611 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  44.03 
 
 
547 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  43.4 
 
 
611 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  45 
 
 
623 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  44.55 
 
 
611 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.52 
 
 
624 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.62 
 
 
542 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  45.23 
 
 
630 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  45 
 
 
623 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.32 
 
 
609 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.01 
 
 
564 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.8 
 
 
612 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
627 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.97 
 
 
575 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  45.51 
 
 
534 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
625 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.17 
 
 
610 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  43.91 
 
 
545 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  45.64 
 
 
542 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  44.8 
 
 
612 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
536 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  46.72 
 
 
533 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
633 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.95 
 
 
615 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 
623 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  46.87 
 
 
544 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
623 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
629 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
623 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.88 
 
 
562 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 
559 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  46.44 
 
 
543 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>