More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4449 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  67.09 
 
 		 547 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  64.83 
 
 		 534 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  81.37 
 
 		 542 aa  909    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  76.92 
 
 		 541 aa  853    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  64.83 
 
 		 536 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  69.78 
 
 		 545 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  64.64 
 
 		 536 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  62.11 
 
 		 543 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  65.22 
 
 		 537 aa  690    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  100 
 
 		 545 aa  1108    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  69.93 
 
 		 545 aa  763    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  67.89 
 
 		 545 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  63.12 
 
 		 536 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  62.66 
 
 		 543 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  66.42 
 
 		 545 aa  690    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  64.64 
 
 		 535 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  65.57 
 
 		 553 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  64.41 
 
 		 543 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  64.45 
 
 		 536 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  67.9 
 
 		 545 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  66.48 
 
 		 550 aa  696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  62.12 
 
 		 531 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  61.48 
 
 		 533 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  70.9 
 
 		 545 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  65.49 
 
 		 537 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  76.54 
 
 		 553 aa  856    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  82.29 
 
 		 542 aa  921    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  68.07 
 
 		 545 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  65.47 
 
 		 530 aa  690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  76.55 
 
 		 550 aa  847    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  66.79 
 
 		 542 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  61.89 
 
 		 531 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  69.39 
 
 		 543 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  64.45 
 
 		 535 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  63.58 
 
 		 533 aa  675    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  61.51 
 
 		 530 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  96.88 
 
 		 545 aa  1077    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  74.63 
 
 		 542 aa  839    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  64.34 
 
 		 537 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  66.73 
 
 		 539 aa  680    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  66.61 
 
 		 542 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.77 
 
 		 536 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  66.42 
 
 		 542 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  66.92 
 
 		 571 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  67.22 
 
 		 542 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  63.16 
 
 		 537 aa  664    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.92 
 
 		 525 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 529 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 527 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  59.92 
 
 		 525 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  57.95 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  60.68 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 		 529 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 		 529 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  57.95 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  57.77 
 
 		 529 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  57.77 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  57.58 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  61.06 
 
 		 524 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  57.77 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  58.11 
 
 		 534 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  59.55 
 
 		 527 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 530 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  57.95 
 
 		 539 aa  614  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  57.2 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  55.84 
 
 		 538 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  57.01 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  57.25 
 
 		 536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  57.14 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  56.88 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  58.03 
 
 		 539 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.01 
 
 		 529 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  56.88 
 
 		 536 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  58.03 
 
 		 539 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  56.74 
 
 		 543 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  57.12 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  57.44 
 
 		 530 aa  594  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  57.66 
 
 		 539 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  56.9 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 		 530 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.2 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.2 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.2 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  58.49 
 
 		 527 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2570  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.01 
 
 		 529 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182676 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  53.57 
 
 		 543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  57.09 
 
 		 544 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  53.38 
 
 		 543 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  53.58 
 
 		 539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3249  ABC transporter-related protein  56.14 
 
 		 530 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0370695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  54.05 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  51.78 
 
 		 530 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  53.66 
 
 		 556 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  53.01 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  53.01 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  51.23 
 
 		 532 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  54.8 
 
 		 551 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 540 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>