More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  63.89 
 
 
542 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  82.64 
 
 
534 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  85.63 
 
 
537 aa  932    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 
541 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  68.44 
 
 
527 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.25 
 
 
525 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  84.36 
 
 
536 aa  918    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  60.86 
 
 
533 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  67.42 
 
 
527 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  83.8 
 
 
536 aa  913    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  68.63 
 
 
525 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  62.93 
 
 
553 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  62.12 
 
 
550 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  63.57 
 
 
545 aa  675    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  83.11 
 
 
535 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  84.08 
 
 
536 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  68.82 
 
 
524 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  67.49 
 
 
527 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  71.83 
 
 
537 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  64.15 
 
 
553 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  64.27 
 
 
542 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  60.82 
 
 
545 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  64.03 
 
 
542 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  62.57 
 
 
545 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  62.97 
 
 
542 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  61.15 
 
 
545 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  63.16 
 
 
542 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  62.38 
 
 
543 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  60.9 
 
 
530 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
530 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  64.41 
 
 
530 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  65.3 
 
 
545 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  82.73 
 
 
535 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  83.3 
 
 
536 aa  853    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  82.4 
 
 
537 aa  888    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  63.4 
 
 
542 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  63.58 
 
 
545 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  61.97 
 
 
545 aa  661    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  64.43 
 
 
547 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  83.15 
 
 
536 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  63.84 
 
 
542 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
537 aa  1066    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  61.45 
 
 
541 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  65.49 
 
 
545 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  59.77 
 
 
538 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
529 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  61.1 
 
 
529 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  61.5 
 
 
537 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  60.72 
 
 
529 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  60.72 
 
 
529 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  60.53 
 
 
529 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  60.72 
 
 
529 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  60.68 
 
 
531 aa  630  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  60.53 
 
 
529 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  60.72 
 
 
529 aa  631  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  61.91 
 
 
545 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  59.92 
 
 
530 aa  626  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 
529 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  61.48 
 
 
543 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  59.55 
 
 
533 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  63.34 
 
 
571 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  62.79 
 
 
539 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  59.62 
 
 
543 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  59.62 
 
 
543 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  61.39 
 
 
531 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.66 
 
 
529 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  59.92 
 
 
530 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  58.86 
 
 
539 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  59.58 
 
 
544 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  59.62 
 
 
530 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  59.13 
 
 
532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2570  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.46 
 
 
529 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.66 
 
 
529 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.66 
 
 
529 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.66 
 
 
529 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.33 
 
 
536 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  58.56 
 
 
530 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  58.81 
 
 
550 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
530 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 
530 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  55.18 
 
 
534 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  56.02 
 
 
534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  53.56 
 
 
530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  55.58 
 
 
536 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  55.39 
 
 
536 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  55.53 
 
 
533 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  53.11 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  51.6 
 
 
543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3249  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 
530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0370695 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
539 aa  558  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  55.49 
 
 
539 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  53.95 
 
 
543 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  51.6 
 
 
543 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  54.92 
 
 
539 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  54.73 
 
 
539 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  54.74 
 
 
548 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  52.83 
 
 
564 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  53.12 
 
 
555 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  52.08 
 
 
555 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
540 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>