More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1478 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  69.01 
 
 		 534 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  76.37 
 
 		 536 aa  821    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 539 aa  1069    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  94.06 
 
 		 539 aa  1006    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  99.44 
 
 		 539 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  75.99 
 
 		 534 aa  823    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  62.48 
 
 		 531 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  66.54 
 
 		 543 aa  705    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  70.97 
 
 		 533 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  76.56 
 
 		 536 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  61.22 
 
 		 532 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 543 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  60.27 
 
 		 536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  60.27 
 
 		 545 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  58.38 
 
 		 541 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  57.01 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  58.03 
 
 		 545 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  58.19 
 
 		 550 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  57.74 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  57.58 
 
 		 542 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.65 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  57.66 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  57.01 
 
 		 542 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  59.25 
 
 		 542 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  54.82 
 
 		 543 aa  591  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  59.25 
 
 		 542 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  57.22 
 
 		 542 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  56.08 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  59.06 
 
 		 542 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 539 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  56.98 
 
 		 530 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  57.28 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  57.22 
 
 		 527 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  58.03 
 
 		 543 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  58.6 
 
 		 530 aa  581  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  59.42 
 
 		 571 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  56.16 
 
 		 545 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  57.84 
 
 		 543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  54.89 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  55.74 
 
 		 533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  59.27 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  56.79 
 
 		 537 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 		 545 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  56.55 
 
 		 547 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  56.82 
 
 		 545 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  56.77 
 
 		 550 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  55.37 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  55.68 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  56.06 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  55.68 
 
 		 543 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  55.85 
 
 		 543 aa  566  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  55.2 
 
 		 532 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  57.03 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  56.33 
 
 		 544 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  55.98 
 
 		 531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  55.68 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  56.1 
 
 		 537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  54.61 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  55.68 
 
 		 537 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  56.06 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  55.43 
 
 		 548 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  54.43 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  54.63 
 
 		 541 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 527 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  54.2 
 
 		 527 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  53.8 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  53.8 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  54.03 
 
 		 537 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  54.92 
 
 		 535 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  54.73 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.04 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  54.17 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  54.56 
 
 		 536 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  58.11 
 
 		 553 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.12 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  54.01 
 
 		 548 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  53.42 
 
 		 537 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  52.05 
 
 		 565 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  51.87 
 
 		 533 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  52.1 
 
 		 547 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  52.25 
 
 		 543 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  53.48 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  51.69 
 
 		 559 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  51.68 
 
 		 540 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  52.35 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  51.87 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  51.31 
 
 		 544 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  51.49 
 
 		 540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  50.46 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  51.87 
 
 		 540 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  53.31 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  51.68 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  51.69 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  51.87 
 
 		 540 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  50.94 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 		 529 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  53.07 
 
 		 544 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>