More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3465 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  100 
 
 
548 aa  1077    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  60.83 
 
 
537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  56.68 
 
 
531 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  55.72 
 
 
539 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  55.35 
 
 
539 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  55.43 
 
 
539 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  52.69 
 
 
534 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 
536 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 
536 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  52.41 
 
 
553 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  57.77 
 
 
532 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  52.81 
 
 
542 aa  541  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  52.62 
 
 
534 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
541 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  53.11 
 
 
533 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
550 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  53.56 
 
 
542 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  52.12 
 
 
545 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  57.77 
 
 
536 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  53.26 
 
 
542 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  51.22 
 
 
543 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  51.38 
 
 
545 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  52.62 
 
 
524 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  52.58 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  53.73 
 
 
542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  52.49 
 
 
543 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  53.16 
 
 
537 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.7 
 
 
525 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  51.51 
 
 
525 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  52.78 
 
 
545 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  52.7 
 
 
535 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  50.56 
 
 
542 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  52.79 
 
 
537 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  52.66 
 
 
547 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  53.26 
 
 
545 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  53.43 
 
 
542 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  53.53 
 
 
542 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  51.48 
 
 
545 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  51.66 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  51.66 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  52.38 
 
 
544 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  53.07 
 
 
537 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 
536 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  51.39 
 
 
536 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  52.34 
 
 
536 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  51.22 
 
 
530 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  52.16 
 
 
533 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  52.06 
 
 
537 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  51.49 
 
 
541 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  52.56 
 
 
543 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
534 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  54.2 
 
 
539 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
564 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 
527 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  52.84 
 
 
527 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  52.51 
 
 
535 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 
539 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  54.22 
 
 
530 aa  498  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  53.24 
 
 
571 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  52.06 
 
 
537 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  51.03 
 
 
531 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  46.94 
 
 
543 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  46.21 
 
 
543 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  51.52 
 
 
527 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  51.12 
 
 
543 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  50.72 
 
 
550 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  51.96 
 
 
536 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  50.56 
 
 
543 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  51.21 
 
 
530 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  50.47 
 
 
533 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  51.22 
 
 
532 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.9 
 
 
536 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.29 
 
 
555 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.37 
 
 
536 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  48.88 
 
 
556 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 
530 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  48.53 
 
 
538 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  50.09 
 
 
540 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  50.27 
 
 
540 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  47.79 
 
 
555 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  48.06 
 
 
555 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  49.82 
 
 
540 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  51.41 
 
 
530 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  50 
 
 
540 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
544 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
529 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
530 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  49.82 
 
 
540 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  49.63 
 
 
544 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
529 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  47.37 
 
 
539 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 
529 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 
543 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  52.54 
 
 
531 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  48.5 
 
 
529 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  49.64 
 
 
540 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 
529 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>