More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3602 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  94.38 
 
 
536 aa  1029    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  75.99 
 
 
539 aa  823    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  76.18 
 
 
539 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  59.32 
 
 
531 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  100 
 
 
534 aa  1083    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  67.11 
 
 
543 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  69.45 
 
 
533 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  68.24 
 
 
534 aa  737    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  75.8 
 
 
539 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  94.57 
 
 
536 aa  1030    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
543 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  55.62 
 
 
543 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  58.03 
 
 
542 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  54.61 
 
 
539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.6 
 
 
525 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  56.88 
 
 
545 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  57.22 
 
 
524 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  57.06 
 
 
542 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  56.58 
 
 
542 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  56.6 
 
 
525 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  57.36 
 
 
542 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  56.69 
 
 
545 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  56.87 
 
 
541 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  56.36 
 
 
533 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  56.98 
 
 
542 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  56.36 
 
 
541 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  56.69 
 
 
550 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  57.31 
 
 
545 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  56.87 
 
 
542 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  56.12 
 
 
553 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  56.79 
 
 
542 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 
527 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  55.51 
 
 
527 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  55 
 
 
547 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  56.93 
 
 
527 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
545 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  55.6 
 
 
537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  56.47 
 
 
535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  56.19 
 
 
532 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  56.17 
 
 
530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  56.23 
 
 
543 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  55.45 
 
 
545 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.06 
 
 
537 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  55.39 
 
 
543 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  57.31 
 
 
571 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  56.73 
 
 
539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  56.04 
 
 
543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  56.02 
 
 
545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  54.96 
 
 
543 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  56.02 
 
 
537 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  54.55 
 
 
532 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  55.64 
 
 
530 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  55.3 
 
 
537 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
536 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  54.89 
 
 
545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  55.26 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  55.95 
 
 
537 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  55.37 
 
 
536 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  55.77 
 
 
545 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  54.55 
 
 
531 aa  571  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  55.22 
 
 
533 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  55.72 
 
 
535 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.72 
 
 
534 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  56.02 
 
 
536 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  55.18 
 
 
536 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  53.38 
 
 
555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  52.69 
 
 
548 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  54.28 
 
 
550 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  57.01 
 
 
553 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.31 
 
 
536 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  53.67 
 
 
555 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  55.56 
 
 
536 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  52.93 
 
 
556 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  53.22 
 
 
544 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  53.67 
 
 
555 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  53.46 
 
 
530 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  54.36 
 
 
551 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  53.5 
 
 
549 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  51.52 
 
 
537 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  51.23 
 
 
538 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  51.04 
 
 
530 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.01 
 
 
536 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  52.65 
 
 
556 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  53.41 
 
 
551 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  53.22 
 
 
551 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  52.08 
 
 
530 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50.85 
 
 
529 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  52.77 
 
 
547 aa  525  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 
548 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
529 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  52.57 
 
 
555 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  50.57 
 
 
530 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  49.43 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  49.72 
 
 
565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  52 
 
 
544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  49.43 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>