More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2005 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  100 
 
 		 552 aa  1113    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  60.85 
 
 		 553 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.17 
 
 		 548 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  62.11 
 
 		 552 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  62.09 
 
 		 557 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  62.66 
 
 		 550 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  59.26 
 
 		 556 aa  598  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  54.41 
 
 		 532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  57.33 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  56.95 
 
 		 541 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  53.38 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  57.2 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 544 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  55.06 
 
 		 585 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  58.51 
 
 		 549 aa  548  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  54.73 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  55.09 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  52.61 
 
 		 538 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  54.91 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  55.87 
 
 		 560 aa  535  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  54.34 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  55.37 
 
 		 538 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  53.96 
 
 		 556 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  54.61 
 
 		 540 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  51.97 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  51.31 
 
 		 558 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  50.73 
 
 		 552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 540 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  54.27 
 
 		 552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  53.7 
 
 		 554 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  51.89 
 
 		 547 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  50.94 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  54.44 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  52.07 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  48.96 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.19 
 
 		 546 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  52.15 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  48.86 
 
 		 542 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  46.11 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.86 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  48.96 
 
 		 592 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  49.43 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  48.78 
 
 		 592 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.65 
 
 		 611 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  46.22 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.27 
 
 		 617 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.4 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.32 
 
 		 562 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  44.1 
 
 		 599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.57 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.25 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  47.08 
 
 		 555 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.9 
 
 		 546 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.42 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 		 627 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  44.88 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 		 543 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  43.82 
 
 		 597 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.4 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.23 
 
 		 564 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  46.37 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.63 
 
 		 640 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  46.11 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 601 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.91 
 
 		 534 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 623 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  46.52 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.55 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  46.34 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.8 
 
 		 623 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.86 
 
 		 543 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.49 
 
 		 543 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  45.72 
 
 		 633 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  46.14 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  45.64 
 
 		 543 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.17 
 
 		 615 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 		 625 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.55 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.76 
 
 		 619 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  44.16 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.42 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 		 559 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.82 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  44.67 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.31 
 
 		 626 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.96 
 
 		 613 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  44.4 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  44.31 
 
 		 629 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 629 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  45.79 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  46.74 
 
 		 586 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  44.84 
 
 		 630 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 		 649 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.36 
 
 		 588 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  45.44 
 
 		 593 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>