More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1496 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  100 
 
 		 532 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  59.28 
 
 		 541 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  56.29 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  56.29 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  55.72 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.21 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  53.85 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  57.22 
 
 		 550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  54.41 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  57.36 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 544 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  52.92 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  52.73 
 
 		 556 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  52.83 
 
 		 534 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  50.28 
 
 		 538 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  53.66 
 
 		 552 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  53.1 
 
 		 552 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  53.17 
 
 		 552 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  52.74 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  50.66 
 
 		 545 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  51.89 
 
 		 534 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  52.34 
 
 		 556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  51.6 
 
 		 540 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  50.19 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  48.97 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  51.78 
 
 		 538 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.85 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  49.44 
 
 		 547 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  52.35 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  51.04 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  53.01 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  51.04 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  50.09 
 
 		 557 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  50.57 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  49.81 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  51.5 
 
 		 560 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  46.27 
 
 		 546 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  46.11 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  45.78 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.4 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 		 543 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.11 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  48.59 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.45 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  44.42 
 
 		 543 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  46.18 
 
 		 576 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  45.59 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  44.8 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.73 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  43.98 
 
 		 522 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  48.5 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41 
 
 		 564 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.52 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.88 
 
 		 617 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.47 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.84 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.2 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.6 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.08 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  46.03 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  44.84 
 
 		 543 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 		 609 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  44.07 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.36 
 
 		 616 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  44.34 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.9 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.19 
 
 		 612 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.73 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  41.09 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  41.09 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.96 
 
 		 572 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  46.94 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  45.47 
 
 		 545 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.53 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.3 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  45.39 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.99 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.61 
 
 		 542 aa  425  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.99 
 
 		 536 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  46.55 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  46.36 
 
 		 592 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  44.89 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.27 
 
 		 611 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  45.23 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.36 
 
 		 547 aa  422  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.27 
 
 		 610 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  43.49 
 
 		 593 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.47 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  45.2 
 
 		 544 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.91 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  42.21 
 
 		 619 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  46.84 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>