More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0602 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  100 
 
 		 539 aa  1073    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  58.12 
 
 		 571 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  55.04 
 
 		 558 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  48.98 
 
 		 547 aa  502  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  46.27 
 
 		 583 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  47.19 
 
 		 606 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.45 
 
 		 568 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50.37 
 
 		 537 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  46.14 
 
 		 578 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  50 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  50.94 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 615 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  43.93 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  49.25 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  46.42 
 
 		 612 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  50.28 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.52 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.61 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  46.25 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.96 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  47.4 
 
 		 609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  50.19 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 541 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  43.15 
 
 		 603 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.76 
 
 		 658 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  48.94 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.99 
 
 		 564 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  48.88 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  49.63 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.58 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  50.56 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.03 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.47 
 
 		 536 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.59 
 
 		 617 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.84 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.35 
 
 		 619 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.38 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.49 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  47.79 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  48.78 
 
 		 537 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  49.07 
 
 		 545 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  50.28 
 
 		 545 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.37 
 
 		 534 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.12 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  47.83 
 
 		 597 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  51.25 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  45.59 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  48.41 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  41.32 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  46.79 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.96 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  48.22 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.95 
 
 		 545 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  46.41 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  47.96 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  49.91 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.89 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 632 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  49.04 
 
 		 579 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  42.36 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  47.38 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  50 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.62 
 
 		 609 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  46.41 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  46.83 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  49.42 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.79 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  47.36 
 
 		 527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  47.4 
 
 		 601 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  49.35 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.03 
 
 		 613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  47.88 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  47.78 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 		 633 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  46.93 
 
 		 538 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  47.65 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.82 
 
 		 599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.99 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  46.99 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  50.57 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  47.77 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  51.63 
 
 		 592 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.06 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  48.46 
 
 		 558 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  49.35 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  46.03 
 
 		 628 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.38 
 
 		 536 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  49.72 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  47.65 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 529 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>