More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3970 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.05 
 
 
612 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  53.71 
 
 
611 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
673 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
623 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 
623 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  56.44 
 
 
627 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
623 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  57.77 
 
 
640 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
623 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  56.17 
 
 
611 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.26 
 
 
611 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  56.05 
 
 
612 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  84.03 
 
 
623 aa  1066    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  58.16 
 
 
629 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  55.5 
 
 
611 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.89 
 
 
637 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.31 
 
 
633 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  84.52 
 
 
623 aa  1077    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  54.49 
 
 
612 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.91 
 
 
625 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
623 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.31 
 
 
626 aa  694    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
623 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  58.17 
 
 
633 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
629 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  57.52 
 
 
623 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  53.92 
 
 
611 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.76 
 
 
662 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 
629 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  57.1 
 
 
619 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.41 
 
 
625 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  56.36 
 
 
643 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.43 
 
 
632 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.5 
 
 
619 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  58.18 
 
 
640 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.89 
 
 
634 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
623 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.17 
 
 
623 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
623 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  87.62 
 
 
624 aa  1109    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.52 
 
 
629 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  57.05 
 
 
630 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  56.84 
 
 
625 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
623 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  58.89 
 
 
634 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
673 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.81 
 
 
633 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 
633 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 
623 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.02 
 
 
633 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.3 
 
 
649 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  100 
 
 
640 aa  1301    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.54 
 
 
632 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.89 
 
 
634 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  55.43 
 
 
623 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  54.81 
 
 
664 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.88 
 
 
631 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  52.22 
 
 
619 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  52.81 
 
 
610 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  55.46 
 
 
615 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  54.52 
 
 
613 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.26 
 
 
620 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.81 
 
 
617 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  52.65 
 
 
609 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
601 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  51.08 
 
 
606 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  55.09 
 
 
595 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  54.58 
 
 
613 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  51.75 
 
 
597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.58 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  51.41 
 
 
593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  51.91 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  50.77 
 
 
599 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  52.1 
 
 
562 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  50.33 
 
 
586 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  50 
 
 
592 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
620 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  47.04 
 
 
588 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  49.34 
 
 
592 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  49.5 
 
 
592 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45.17 
 
 
609 aa  530  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.68 
 
 
619 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  48.86 
 
 
578 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.21 
 
 
627 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  48.54 
 
 
583 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.47 
 
 
568 aa  524  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.43 
 
 
596 aa  522  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  44.72 
 
 
617 aa  521  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  47.03 
 
 
624 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  46.39 
 
 
624 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  44.63 
 
 
617 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  47.87 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.62 
 
 
686 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.28 
 
 
545 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.34 
 
 
576 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.26 
 
 
712 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  48.11 
 
 
547 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  49.04 
 
 
566 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  48.08 
 
 
603 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>