More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1648 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  73.02 
 
 		 534 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  100 
 
 		 538 aa  1075    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  75.85 
 
 		 534 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  64 
 
 		 539 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  70 
 
 		 538 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  63.31 
 
 		 585 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  70.75 
 
 		 540 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  75.89 
 
 		 544 aa  804    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  71.67 
 
 		 534 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  58.71 
 
 		 547 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  58 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  57.14 
 
 		 549 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  57.84 
 
 		 557 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  58.65 
 
 		 545 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  57.44 
 
 		 540 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  57.5 
 
 		 546 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  56.64 
 
 		 545 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  57.84 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  58.24 
 
 		 552 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  58.1 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  56.47 
 
 		 552 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  56.47 
 
 		 552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  58.16 
 
 		 560 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  55.39 
 
 		 541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.29 
 
 		 540 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  53.46 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  56.29 
 
 		 552 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  57.82 
 
 		 549 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  52.61 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  53.37 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  53.56 
 
 		 553 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  50.28 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  51.78 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  54.02 
 
 		 556 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  53.27 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  52.5 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  51.61 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  49.82 
 
 		 624 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  49.28 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  48.65 
 
 		 612 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  49.91 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  49.18 
 
 		 615 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  50.82 
 
 		 613 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  49.47 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.38 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  43.5 
 
 		 564 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.37 
 
 		 617 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  46.39 
 
 		 624 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  46.95 
 
 		 546 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  47.77 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  49.91 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  48.21 
 
 		 629 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  49.72 
 
 		 539 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.5 
 
 		 623 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.94 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  46.14 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  45.49 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  50.18 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  46.65 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  49.34 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  46.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.45 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  47.53 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.46 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.66 
 
 		 619 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  46.69 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  46.05 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.29 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.31 
 
 		 610 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  45.52 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.41 
 
 		 610 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.84 
 
 		 542 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  50.39 
 
 		 592 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.59 
 
 		 568 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  50.19 
 
 		 586 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  48.68 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  48.31 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 609 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 563 aa  458  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.81 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  48.79 
 
 		 547 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.24 
 
 		 562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.7 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.92 
 
 		 566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  41.99 
 
 		 627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  50.2 
 
 		 592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.42 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.52 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  45.15 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.14 
 
 		 625 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>