More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1353 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  58.32 
 
 
612 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 
623 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  58.32 
 
 
623 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.97 
 
 
610 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  59.8 
 
 
627 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  58.65 
 
 
629 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  60.26 
 
 
640 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
623 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.57 
 
 
662 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
623 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
673 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  58.22 
 
 
623 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.86 
 
 
633 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  63.36 
 
 
595 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  89.82 
 
 
613 aa  1055    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  60.44 
 
 
629 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  58.48 
 
 
623 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
623 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 
623 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.95 
 
 
649 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  64.32 
 
 
610 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  62.04 
 
 
597 aa  731    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  59.93 
 
 
633 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.81 
 
 
662 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  63.99 
 
 
601 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 
625 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1769  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  55.73 
 
 
676 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.62 
 
 
629 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.44 
 
 
643 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.38 
 
 
633 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
634 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  79.25 
 
 
619 aa  950    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 
623 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.41 
 
 
632 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  58.25 
 
 
619 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  61.44 
 
 
640 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  69.9 
 
 
612 aa  846    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  59.28 
 
 
630 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.46 
 
 
611 aa  824    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  69.13 
 
 
611 aa  836    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  60.16 
 
 
634 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.21 
 
 
623 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  58.32 
 
 
612 aa  672    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  69.35 
 
 
615 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  59.83 
 
 
593 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  63.19 
 
 
609 aa  775    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.22 
 
 
617 aa  831    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.5 
 
 
629 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  58.83 
 
 
623 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.53 
 
 
633 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  71.64 
 
 
611 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.33 
 
 
620 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
634 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.1 
 
 
637 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  100 
 
 
613 aa  1214    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 
623 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  56.77 
 
 
664 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.74 
 
 
632 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.77 
 
 
631 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  55.78 
 
 
679 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  70.81 
 
 
611 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  58.24 
 
 
625 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.27 
 
 
625 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.47 
 
 
626 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
673 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 
623 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.55 
 
 
633 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  54.44 
 
 
640 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  55.15 
 
 
611 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  57.17 
 
 
609 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  53.68 
 
 
588 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  54.5 
 
 
599 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  53.9 
 
 
606 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  52.81 
 
 
623 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  53.3 
 
 
619 aa  608  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  52.74 
 
 
624 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
623 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  54.53 
 
 
592 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  54.19 
 
 
592 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  56.74 
 
 
562 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  54.03 
 
 
592 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.58 
 
 
596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
620 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  53.17 
 
 
568 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  48.95 
 
 
578 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
609 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  51.43 
 
 
586 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  49.4 
 
 
583 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  46.74 
 
 
617 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.15 
 
 
695 aa  528  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
711 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
615 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  49.66 
 
 
568 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  48.34 
 
 
582 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  51.75 
 
 
571 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  48.06 
 
 
586 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  46.17 
 
 
564 aa  515  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
619 aa  512  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 
540 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  44.07 
 
 
627 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>