More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  69.09 
 
 		 543 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 531 aa  1038    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  69.09 
 
 		 543 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  68.17 
 
 		 532 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  69.09 
 
 		 543 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  67.23 
 
 		 535 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 867 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.15 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.25 
 
 		 606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  48.24 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  50.19 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.74 
 
 		 599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.54 
 
 		 562 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.53 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  49.81 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  50.28 
 
 		 539 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  49.63 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.43 
 
 		 619 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  49.16 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 550 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  48.58 
 
 		 527 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.98 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.34 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.28 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  46.11 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  47.92 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  48.31 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  48.3 
 
 		 537 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  47.85 
 
 		 534 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.84 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  44.54 
 
 		 609 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  47.53 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 		 536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.94 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  50.38 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.47 
 
 		 632 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47.11 
 
 		 542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.47 
 
 		 612 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.74 
 
 		 586 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.8 
 
 		 576 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 		 629 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  48.59 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 		 633 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  45.47 
 
 		 612 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 		 536 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.25 
 
 		 617 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  49.63 
 
 		 537 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.96 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  45.47 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.59 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  44.27 
 
 		 612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  48.97 
 
 		 592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  46.06 
 
 		 625 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.94 
 
 		 643 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.58 
 
 		 537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  46.83 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  46.2 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.24 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.91 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.01 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.68 
 
 		 625 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  44.5 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  47.58 
 
 		 593 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  43.32 
 
 		 610 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  48.59 
 
 		 543 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  48.6 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  49.34 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.85 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  48.41 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 625 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.72 
 
 		 575 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 		 629 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 601 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.64 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  47.17 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.09 
 
 		 640 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 		 632 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  45.21 
 
 		 630 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  45.54 
 
 		 582 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>