More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1631 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  54.66 
 
 
627 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  53.81 
 
 
617 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  53.92 
 
 
617 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  100 
 
 
578 aa  1199    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 
609 aa  718    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  57.59 
 
 
583 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  54.58 
 
 
564 aa  627  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  52.76 
 
 
620 aa  611  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  50.55 
 
 
647 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  51.21 
 
 
612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  50.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.12 
 
 
617 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.48 
 
 
633 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 
623 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.47 
 
 
611 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  50.09 
 
 
640 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  49.83 
 
 
640 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  49.56 
 
 
611 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.83 
 
 
633 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 
633 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.95 
 
 
619 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.95 
 
 
613 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50.26 
 
 
634 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.04 
 
 
626 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  50 
 
 
615 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
623 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.16 
 
 
632 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.26 
 
 
634 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.44 
 
 
612 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  48.44 
 
 
623 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  49.04 
 
 
611 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  48.44 
 
 
612 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
623 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.66 
 
 
634 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
629 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
633 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
623 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
649 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 
623 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  48.44 
 
 
623 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 
623 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 
623 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.92 
 
 
662 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  48.44 
 
 
623 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 
623 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 
629 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  48.86 
 
 
640 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.72 
 
 
611 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  48.86 
 
 
611 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.98 
 
 
609 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 
623 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  48.09 
 
 
664 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.48 
 
 
637 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
662 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  48 
 
 
619 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
629 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.89 
 
 
643 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.72 
 
 
632 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
673 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
673 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 
627 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.53 
 
 
625 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  48.25 
 
 
613 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  47.13 
 
 
623 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  47.56 
 
 
630 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
623 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  47.72 
 
 
624 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
631 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
679 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
625 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.9 
 
 
625 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.39 
 
 
619 aa  531  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.74 
 
 
629 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.56 
 
 
597 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  46.49 
 
 
623 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  47.89 
 
 
593 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.28 
 
 
610 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
593 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.43 
 
 
568 aa  521  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  48.01 
 
 
554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  44.99 
 
 
601 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  46.57 
 
 
586 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
601 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  45.92 
 
 
553 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  47.22 
 
 
547 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.14 
 
 
620 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.57 
 
 
571 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.96 
 
 
609 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  47.01 
 
 
606 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  46.27 
 
 
571 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
550 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 
558 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.53 
 
 
543 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.21 
 
 
531 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  45.68 
 
 
593 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.89 
 
 
542 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.64 
 
 
562 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.55 
 
 
592 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  45.83 
 
 
537 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>