More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2773 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
558 aa  1132    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  70.07 
 
 
571 aa  766    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
539 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
609 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.72 
 
 
540 aa  525  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  49.55 
 
 
545 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
620 aa  524  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.93 
 
 
658 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  48.32 
 
 
547 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  49.73 
 
 
542 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  49.55 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  49.55 
 
 
542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  45.56 
 
 
617 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.56 
 
 
626 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  50.09 
 
 
542 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  47.24 
 
 
623 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  50.09 
 
 
542 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  48.19 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  49.91 
 
 
542 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  48.76 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  50.35 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  48.06 
 
 
609 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.9 
 
 
617 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
541 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.66 
 
 
553 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  46.82 
 
 
583 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.16 
 
 
627 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  47.33 
 
 
623 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 
623 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  48.39 
 
 
606 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  51.15 
 
 
613 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 
633 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50 
 
 
537 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  49.37 
 
 
609 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  47.78 
 
 
611 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  48.46 
 
 
542 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  48.52 
 
 
633 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  51.91 
 
 
530 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  48.76 
 
 
615 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.74 
 
 
547 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.31 
 
 
612 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  49.36 
 
 
535 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
623 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.35 
 
 
640 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  48.74 
 
 
537 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  49.01 
 
 
536 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 
545 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  50.26 
 
 
613 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.73 
 
 
543 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
550 aa  498  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.61 
 
 
612 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 
629 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
625 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  48.49 
 
 
623 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
545 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  48.31 
 
 
612 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.24 
 
 
625 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  47.61 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 
623 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.44 
 
 
634 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.46 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.54 
 
 
632 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 
634 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 
627 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
536 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
633 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 
634 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  45.59 
 
 
530 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 
633 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.83 
 
 
640 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
623 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.73 
 
 
630 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.58 
 
 
640 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  49.01 
 
 
537 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
623 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 
637 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
563 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 
625 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.45 
 
 
617 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.61 
 
 
623 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  42.64 
 
 
602 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  47.85 
 
 
607 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
659 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  49 
 
 
535 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  47.67 
 
 
545 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.87 
 
 
633 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.37 
 
 
542 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  50.36 
 
 
545 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.21 
 
 
629 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.13 
 
 
619 aa  485  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.29 
 
 
568 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.21 
 
 
543 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  48.64 
 
 
532 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.38 
 
 
632 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  49.45 
 
 
571 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>