More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0237 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  61.5 
 
 
612 aa  784    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  61.66 
 
 
623 aa  785    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  69.4 
 
 
627 aa  904    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  53.44 
 
 
610 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  65.51 
 
 
633 aa  839    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  54.94 
 
 
611 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  68.98 
 
 
637 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
623 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  98.94 
 
 
662 aa  1225    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  56.42 
 
 
611 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  70.71 
 
 
629 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0325  putative ATP-binding ABC transporter protein  97.66 
 
 
685 aa  1250    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 
623 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  80.09 
 
 
649 aa  1041    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  79.44 
 
 
633 aa  1046    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  54.66 
 
 
619 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  89.6 
 
 
662 aa  1143    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
623 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  57.62 
 
 
619 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.06 
 
 
617 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  56.13 
 
 
613 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  61.5 
 
 
612 aa  784    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  69.72 
 
 
643 aa  897    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  70.78 
 
 
632 aa  927    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  60.59 
 
 
619 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 
623 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  76.84 
 
 
640 aa  998    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
623 aa  786    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  61.5 
 
 
623 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  69.97 
 
 
630 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  53.06 
 
 
623 aa  663    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  75.34 
 
 
632 aa  991    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  53.75 
 
 
611 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  80 
 
 
634 aa  1027    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  80.15 
 
 
633 aa  1025    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  69.55 
 
 
629 aa  903    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 
623 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.22 
 
 
626 aa  867    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  55.69 
 
 
615 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  61.81 
 
 
629 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 
623 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  67.02 
 
 
625 aa  859    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 
623 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  69.77 
 
 
629 aa  917    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  79.85 
 
 
633 aa  1049    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  65.08 
 
 
633 aa  835    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  80 
 
 
634 aa  1027    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  55.85 
 
 
613 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  53.63 
 
 
609 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  79.73 
 
 
634 aa  1024    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  53.6 
 
 
640 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.23 
 
 
631 aa  888    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  98.53 
 
 
679 aa  1251    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 
623 aa  800    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
623 aa  786    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.61 
 
 
625 aa  920    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  53.12 
 
 
624 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
673 aa  1329    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  54.07 
 
 
611 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  53.06 
 
 
623 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  76.84 
 
 
640 aa  1004    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  97.77 
 
 
664 aa  1244    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.23 
 
 
625 aa  924    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1769  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  98.08 
 
 
676 aa  1225    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
673 aa  1329    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  56.34 
 
 
612 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 
623 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.61 
 
 
611 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  52.52 
 
 
601 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  51.53 
 
 
597 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.97 
 
 
610 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.1 
 
 
620 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  52.92 
 
 
595 aa  601  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  51.38 
 
 
593 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  48.12 
 
 
599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
609 aa  569  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.17 
 
 
596 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.79 
 
 
627 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  45.36 
 
 
617 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  47.63 
 
 
583 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  47.55 
 
 
578 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
620 aa  529  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
615 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.86 
 
 
617 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.2 
 
 
571 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
736 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  46.58 
 
 
586 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.28 
 
 
711 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
659 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  41.77 
 
 
647 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 
674 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.18 
 
 
699 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.84 
 
 
695 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  42.6 
 
 
564 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  46.76 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
703 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
708 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.05 
 
 
599 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.44 
 
 
671 aa  489  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.77 
 
 
593 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>