More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1819 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  100 
 
 
593 aa  1188    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  76.63 
 
 
593 aa  891    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  72.01 
 
 
601 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
629 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
623 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
623 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
623 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
623 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
609 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
623 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 
623 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  50.35 
 
 
612 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  50.35 
 
 
612 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
623 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
623 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
623 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
623 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
623 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.26 
 
 
626 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  49.91 
 
 
586 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.2 
 
 
599 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  49.29 
 
 
612 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  49.31 
 
 
615 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
625 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
623 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  47.89 
 
 
578 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 
629 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  45.45 
 
 
564 aa  518  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 
619 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.72 
 
 
643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.67 
 
 
611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.31 
 
 
623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 
625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.43 
 
 
629 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.04 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  48.6 
 
 
627 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  47.16 
 
 
583 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.33 
 
 
619 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  49.21 
 
 
562 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.51 
 
 
617 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.86 
 
 
619 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.61 
 
 
629 aa  514  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  47.54 
 
 
568 aa  514  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 
625 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.79 
 
 
611 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 
711 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  45.83 
 
 
617 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.15 
 
 
571 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
633 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  48.34 
 
 
566 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.8 
 
 
629 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  44.77 
 
 
627 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  46.52 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  48.5 
 
 
609 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.64 
 
 
623 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
677 aa  503  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.69 
 
 
712 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  47.42 
 
 
573 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  47.82 
 
 
640 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  47.05 
 
 
546 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.3 
 
 
611 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.14 
 
 
606 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  47.79 
 
 
571 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
632 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
623 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.9 
 
 
599 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.97 
 
 
613 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.89 
 
 
632 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.14 
 
 
630 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 
633 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.6 
 
 
640 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 
633 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.36 
 
 
597 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  47.92 
 
 
633 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.2 
 
 
640 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  48.14 
 
 
613 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  46.69 
 
 
611 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.85 
 
 
534 aa  495  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.47 
 
 
579 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
749 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.59 
 
 
568 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 
631 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
649 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.71 
 
 
611 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
536 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  46.95 
 
 
624 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.86 
 
 
534 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
547 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.55 
 
 
624 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.21 
 
 
609 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.86 
 
 
549 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  46.82 
 
 
575 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  47.17 
 
 
576 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  45.32 
 
 
664 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.41 
 
 
539 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  44.89 
 
 
617 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.01 
 
 
610 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
539 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 
633 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.41 
 
 
539 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>