More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2847 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  93.15 
 
 		 540 aa  996    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  92.96 
 
 		 540 aa  993    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1075    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  55.93 
 
 		 551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  55.45 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  54.83 
 
 		 543 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  54.28 
 
 		 543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  56.37 
 
 		 538 aa  561  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  51.3 
 
 		 545 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  53.16 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  53.01 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 611 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  55.3 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.63 
 
 		 613 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  48.24 
 
 		 613 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  51.65 
 
 		 550 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.69 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 		 614 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 614 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.88 
 
 		 613 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  50.09 
 
 		 608 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  49.16 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  51.75 
 
 		 531 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  48.22 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 		 552 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  50.09 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  48.85 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  49.06 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  48.71 
 
 		 624 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  48.53 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  48.42 
 
 		 621 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  48.33 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  48.53 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  48.69 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  47.75 
 
 		 665 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.68 
 
 		 582 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.23 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  42.91 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  42.91 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  42.91 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  42.8 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  37.68 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  43.38 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.99 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  41.3 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  38.34 
 
 		 578 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 571 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  42.66 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.75 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  41.28 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.29 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  42.16 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  41.28 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.39 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  39.96 
 
 		 640 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.6 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  37.72 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.22 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  36.28 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  40.98 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  39.86 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  39.52 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  43.94 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 544 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  41.17 
 
 		 602 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  38.27 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.34 
 
 		 531 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  38.09 
 
 		 572 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  43.1 
 
 		 585 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  41.5 
 
 		 532 aa  364  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  42.61 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  39.54 
 
 		 624 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 530 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  38.52 
 
 		 538 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.1 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  40.56 
 
 		 568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  40.11 
 
 		 575 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.72 
 
 		 627 aa  362  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.51 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  43.15 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  42.91 
 
 		 534 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  40 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  37.46 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  41.17 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.1 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  40 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  42.23 
 
 		 530 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  39.66 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  39.1 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  35.82 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.08 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  39.32 
 
 		 537 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 529 aa  360  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.74 
 
 		 539 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>