More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1269 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  99.28 
 
 		 559 aa  1073    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  100 
 
 		 559 aa  1082    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  62.06 
 
 		 543 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  100 
 
 		 559 aa  1082    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  62.68 
 
 		 547 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  59.12 
 
 		 536 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  53.1 
 
 		 562 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  52.98 
 
 		 566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  53.07 
 
 		 569 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  55.51 
 
 		 579 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  55.52 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  52.2 
 
 		 563 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  52.61 
 
 		 550 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  48.73 
 
 		 562 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  53.35 
 
 		 594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  51.66 
 
 		 551 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.18 
 
 		 593 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.82 
 
 		 661 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  50.92 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.58 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  44.26 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  50.58 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  45.84 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.67 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  48.98 
 
 		 538 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  46.82 
 
 		 592 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.29 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.08 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.74 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  45.66 
 
 		 597 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  45.81 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  44.09 
 
 		 573 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  44.22 
 
 		 561 aa  412  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  45.23 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  45 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.04 
 
 		 539 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.75 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  47.89 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  47.28 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.27 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 		 571 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  44.53 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.75 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  45.37 
 
 		 599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  45.18 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.24 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.57 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  46.67 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.2 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  45.95 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.67 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  48.19 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.52 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  39.96 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.03 
 
 		 626 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  39.08 
 
 		 566 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.3 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  47.42 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  44.77 
 
 		 542 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  47.05 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  43.89 
 
 		 576 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  40.14 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  44.99 
 
 		 602 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.43 
 
 		 624 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.82 
 
 		 609 aa  402  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  47.39 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.2 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 544 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  45.52 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  46.76 
 
 		 619 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.04 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 593 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.23 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.72 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.73 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.11 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.75 
 
 		 640 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 623 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  44.87 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  42.4 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  46.96 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  43.16 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  44.81 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.58 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 623 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  41.86 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>