More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5377 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  100 
 
 		 555 aa  1127    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.51 
 
 		 546 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.32 
 
 		 543 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.19 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  44.94 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.52 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  42.3 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 623 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  44.55 
 
 		 533 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  43.39 
 
 		 533 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  42.62 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 544 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.9 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  41.15 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  43.87 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.03 
 
 		 619 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.04 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  40.04 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  40.97 
 
 		 532 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  43.87 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.57 
 
 		 623 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  40.61 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.75 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  40.15 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.21 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 547 aa  399  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  42.39 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  40.33 
 
 		 588 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  38.37 
 
 		 605 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  42.83 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.28 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 		 545 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  42.33 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  40.89 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  40.04 
 
 		 624 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  43.66 
 
 		 547 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  41.71 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.1 
 
 		 617 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  40.82 
 
 		 613 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  41.2 
 
 		 586 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  39.86 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  39.71 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  42.8 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  39.93 
 
 		 549 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  39.89 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  40.11 
 
 		 543 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  43.12 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  41.07 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  40.65 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  41.19 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.06 
 
 		 611 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  39.9 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.5 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  43.33 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  41.1 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.34 
 
 		 612 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  39.86 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.78 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  40.75 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 		 536 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.15 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.57 
 
 		 575 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  40.41 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.95 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  39 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  40.63 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  39.78 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 572 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  42.32 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  40.36 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  41.84 
 
 		 571 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  38.09 
 
 		 597 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  41.55 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  41.37 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  40.21 
 
 		 610 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  39.46 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  39.53 
 
 		 615 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  41.21 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.33 
 
 		 550 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 601 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  41.17 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.56 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  41.35 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  43.04 
 
 		 592 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  40.15 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 536 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  40.5 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  39.02 
 
 		 631 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  39.56 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  39.96 
 
 		 543 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  39.93 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>