More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0061 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  61.06 
 
 		 613 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  61.06 
 
 		 613 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  61.96 
 
 		 621 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  59.1 
 
 		 613 aa  707    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  100 
 
 		 608 aa  1212    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  70.76 
 
 		 550 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  60.13 
 
 		 614 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  62.46 
 
 		 665 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  56.97 
 
 		 603 aa  661    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 		 614 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  60.99 
 
 		 624 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.99 
 
 		 611 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  61.63 
 
 		 624 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  60.83 
 
 		 624 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  70.87 
 
 		 546 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  60.83 
 
 		 624 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.98 
 
 		 582 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.92 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  57.62 
 
 		 551 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  57.62 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  59.29 
 
 		 553 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  57.12 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  58.05 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  51.49 
 
 		 551 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  49.81 
 
 		 543 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  49.81 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  50.09 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  48.77 
 
 		 543 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  49.81 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  49.33 
 
 		 545 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  48.94 
 
 		 535 aa  492  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  48.36 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  48.96 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  47.7 
 
 		 538 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.22 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  47.05 
 
 		 531 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  42.72 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  38.72 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  40.23 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  41.37 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.29 
 
 		 532 aa  359  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.19 
 
 		 596 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 557 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  39.25 
 
 		 583 aa  353  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  38.33 
 
 		 561 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  40.43 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  37.52 
 
 		 522 aa  351  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.71 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  37.37 
 
 		 583 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 546 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  38.88 
 
 		 538 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  41.28 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  37.13 
 
 		 545 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  42.12 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  41.28 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  41.28 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.48 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  38.5 
 
 		 568 aa  347  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  38.08 
 
 		 588 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  38.06 
 
 		 539 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  38.1 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.96 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.25 
 
 		 538 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  40.3 
 
 		 545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.76 
 
 		 546 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.13 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.07 
 
 		 633 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 563 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.72 
 
 		 540 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  40.3 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 629 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  343  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 		 623 aa  343  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.72 
 
 		 549 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 		 602 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.38 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.14 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 544 aa  342  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  37.14 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  36.82 
 
 		 572 aa  342  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.09 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  39.11 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.56 
 
 		 613 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  38.63 
 
 		 546 aa  340  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  36.99 
 
 		 547 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>