More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2456 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  100 
 
 
566 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  55.54 
 
 
603 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  56.14 
 
 
607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  54.95 
 
 
563 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  52.66 
 
 
586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.08 
 
 
597 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  50.35 
 
 
564 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  50.52 
 
 
619 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  54.42 
 
 
554 aa  528  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  51.8 
 
 
576 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  50.7 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.98 
 
 
616 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.17 
 
 
575 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  47.32 
 
 
569 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.07 
 
 
568 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  45.77 
 
 
565 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  46.25 
 
 
619 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  47.2 
 
 
606 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
623 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  46.86 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  53.27 
 
 
592 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.71 
 
 
568 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  53.08 
 
 
592 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  53.08 
 
 
592 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  47.34 
 
 
599 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  48.45 
 
 
539 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.68 
 
 
611 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 
633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  45.95 
 
 
611 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.46 
 
 
633 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.76 
 
 
564 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  45.5 
 
 
611 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
539 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.03 
 
 
630 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.69 
 
 
562 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.49 
 
 
599 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  45.19 
 
 
570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.48 
 
 
640 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  45.92 
 
 
597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.75 
 
 
629 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.59 
 
 
543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 
629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  47.16 
 
 
613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  44.31 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  48.14 
 
 
606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
623 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 
629 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  47.41 
 
 
540 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.6 
 
 
624 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  48.19 
 
 
545 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 
539 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.25 
 
 
623 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  48.1 
 
 
546 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  46.49 
 
 
593 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  45.52 
 
 
625 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.65 
 
 
566 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  47.02 
 
 
609 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  45.09 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  44.07 
 
 
547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.27 
 
 
619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  48.01 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.96 
 
 
612 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  44.92 
 
 
611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.68 
 
 
626 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  47.99 
 
 
544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.77 
 
 
609 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.06 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.46 
 
 
617 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  45.36 
 
 
629 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  47.99 
 
 
544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  47.47 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.8 
 
 
619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  41.61 
 
 
566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  44.97 
 
 
623 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
540 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 
625 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
632 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.68 
 
 
571 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  48.82 
 
 
534 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
625 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
571 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  46.08 
 
 
538 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  47.07 
 
 
543 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  44.62 
 
 
631 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.21 
 
 
629 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  45.32 
 
 
556 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  47.79 
 
 
544 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
541 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  47.88 
 
 
544 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.53 
 
 
640 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.15 
 
 
628 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>