More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1962 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  65.39 
 
 
600 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  61.93 
 
 
588 aa  678    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  60.95 
 
 
594 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  62.14 
 
 
571 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  61.74 
 
 
573 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  100 
 
 
573 aa  1112    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.88 
 
 
643 aa  686    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  60.43 
 
 
541 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  61.4 
 
 
548 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.16 
 
 
584 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  59.57 
 
 
551 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  63.36 
 
 
665 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.44 
 
 
661 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  54.1 
 
 
565 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  50.68 
 
 
597 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  50.8 
 
 
546 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  59.5 
 
 
669 aa  508  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  50.98 
 
 
558 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.36 
 
 
674 aa  506  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  48.14 
 
 
561 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
565 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  50.77 
 
 
619 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.5 
 
 
583 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  52.98 
 
 
563 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  56.19 
 
 
528 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 
557 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  54.4 
 
 
575 aa  485  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  51.16 
 
 
545 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.21 
 
 
549 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.64 
 
 
547 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
539 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.83 
 
 
578 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.22 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50.44 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.1 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.25 
 
 
575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.09 
 
 
615 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.15 
 
 
616 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.52 
 
 
612 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.06 
 
 
617 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.98 
 
 
546 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.42 
 
 
606 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.41 
 
 
576 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 
546 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  48.04 
 
 
606 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  46.34 
 
 
593 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.8 
 
 
624 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  47.28 
 
 
609 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  47.1 
 
 
633 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.47 
 
 
609 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.62 
 
 
583 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.3 
 
 
619 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.42 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.66 
 
 
611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.76 
 
 
597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 
633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  50 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.63 
 
 
640 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.99 
 
 
640 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 
634 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  45.52 
 
 
601 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
593 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.64 
 
 
586 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  46.67 
 
 
542 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  46.55 
 
 
566 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  46.23 
 
 
579 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
623 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.52 
 
 
623 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
609 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.63 
 
 
623 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.5 
 
 
599 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  47.57 
 
 
613 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  43.99 
 
 
611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.72 
 
 
640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.06 
 
 
634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  45.07 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  46.98 
 
 
575 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 
572 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
536 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
633 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  46.38 
 
 
547 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  46.36 
 
 
533 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.28 
 
 
708 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  44.11 
 
 
611 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  45.19 
 
 
537 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
677 aa  442  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  43.07 
 
 
620 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 
649 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  44.72 
 
 
572 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.36 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 
602 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  45.45 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  42.13 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  47.07 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  44.12 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  47.8 
 
 
613 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  47.29 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>