More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13693 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  100 
 
 
548 aa  1076    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  61.25 
 
 
588 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  59.93 
 
 
571 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  58.61 
 
 
573 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  59.68 
 
 
594 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  61.4 
 
 
573 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.63 
 
 
643 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  59.15 
 
 
541 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  58.2 
 
 
600 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.28 
 
 
661 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  60.81 
 
 
665 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  56.13 
 
 
584 aa  517  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  52.45 
 
 
619 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  58.52 
 
 
528 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  53.75 
 
 
565 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  56.36 
 
 
551 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  59.07 
 
 
669 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  51.49 
 
 
558 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  49.35 
 
 
565 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  49.54 
 
 
561 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.35 
 
 
674 aa  491  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  50.35 
 
 
597 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  53.16 
 
 
563 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  49.91 
 
 
557 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.79 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 
546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  50 
 
 
546 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.56 
 
 
548 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  51.03 
 
 
538 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.38 
 
 
572 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.65 
 
 
597 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50.37 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.55 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.78 
 
 
549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.71 
 
 
546 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 
539 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  51.39 
 
 
542 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
601 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  50.18 
 
 
575 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  47.02 
 
 
624 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.49 
 
 
593 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
593 aa  438  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.37 
 
 
571 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  43.85 
 
 
606 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.75 
 
 
566 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.04 
 
 
564 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  48.24 
 
 
624 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  50.92 
 
 
559 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  45.34 
 
 
562 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  50.92 
 
 
559 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
602 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.94 
 
 
578 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  45.74 
 
 
579 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  47.76 
 
 
531 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.04 
 
 
590 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  49.91 
 
 
547 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  50.73 
 
 
559 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.59 
 
 
592 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.64 
 
 
539 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
540 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.73 
 
 
575 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.64 
 
 
539 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  46.77 
 
 
592 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.27 
 
 
578 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  48.32 
 
 
631 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  47.14 
 
 
613 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  50.83 
 
 
545 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.9 
 
 
616 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  47.18 
 
 
566 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.3 
 
 
576 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  42.32 
 
 
522 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  43.3 
 
 
611 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
571 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  47.86 
 
 
536 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  49.91 
 
 
547 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  46.28 
 
 
552 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  46.24 
 
 
592 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  41.42 
 
 
583 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  46.2 
 
 
606 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.28 
 
 
619 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  49.26 
 
 
534 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.01 
 
 
586 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  44.12 
 
 
629 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.23 
 
 
609 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.74 
 
 
539 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  45.62 
 
 
550 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  41.35 
 
 
566 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
563 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  45.7 
 
 
558 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.82 
 
 
577 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.58 
 
 
612 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 
548 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.85 
 
 
613 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  47.39 
 
 
539 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
571 aa  422  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  47.89 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.17 
 
 
571 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  45.01 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  43.78 
 
 
611 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>