More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0257 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  82.29 
 
 
674 aa  1129    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  62.62 
 
 
665 aa  796    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
669 aa  1369    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  69.72 
 
 
571 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  68.71 
 
 
573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  62.63 
 
 
643 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  65.48 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
594 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  59.5 
 
 
573 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  58.9 
 
 
600 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  59.07 
 
 
548 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  54.85 
 
 
541 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  54.12 
 
 
584 aa  435  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  55.45 
 
 
551 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  54.23 
 
 
661 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  37.06 
 
 
686 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  52.16 
 
 
546 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0199  ABC transporter related  36.27 
 
 
682 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  52.84 
 
 
565 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  36.06 
 
 
686 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  52.16 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  53.03 
 
 
528 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  50.71 
 
 
561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  49.11 
 
 
619 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  35.08 
 
 
617 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  49.88 
 
 
563 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.6 
 
 
547 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.22 
 
 
627 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
565 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  48.15 
 
 
549 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.81 
 
 
546 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  47.44 
 
 
597 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  49.29 
 
 
557 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 
905 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  46.79 
 
 
593 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.77 
 
 
586 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  48.09 
 
 
505 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  46.08 
 
 
606 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.86 
 
 
583 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  46.34 
 
 
609 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 
539 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.69 
 
 
583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  46.73 
 
 
547 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  49.29 
 
 
575 aa  362  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.5 
 
 
548 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  48.53 
 
 
545 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
593 aa  362  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.43 
 
 
578 aa  361  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.86 
 
 
531 aa  361  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.29 
 
 
546 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  47.18 
 
 
542 aa  359  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
601 aa  359  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  46.21 
 
 
547 aa  359  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.5 
 
 
576 aa  359  9e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  45.65 
 
 
538 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  45.45 
 
 
532 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.99 
 
 
619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.79 
 
 
615 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.55 
 
 
616 aa  358  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  44.89 
 
 
575 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  47.04 
 
 
597 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.82 
 
 
575 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
623 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  45.24 
 
 
566 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
535 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
623 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.18 
 
 
613 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  43.61 
 
 
566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  42.66 
 
 
647 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  44.84 
 
 
611 aa  354  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 
623 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.86 
 
 
564 aa  352  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 
623 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
632 aa  352  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.36 
 
 
609 aa  349  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  43.47 
 
 
627 aa  349  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.52 
 
 
632 aa  349  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.02 
 
 
633 aa  349  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 
623 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.09 
 
 
643 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.5 
 
 
564 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.22 
 
 
547 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.37 
 
 
611 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
623 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
623 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.99 
 
 
617 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.47 
 
 
611 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.6 
 
 
612 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.69 
 
 
562 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 
633 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.66 
 
 
612 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 
623 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
548 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
623 aa  346  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.02 
 
 
571 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.29 
 
 
634 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.66 
 
 
612 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
634 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  40.52 
 
 
617 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>