More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0149 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  100 
 
 		 528 aa  1009    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 541 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  54.48 
 
 		 573 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  53.51 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  53.27 
 
 		 588 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  58.89 
 
 		 548 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  56.37 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  54.28 
 
 		 594 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.77 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.8 
 
 		 584 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.31 
 
 		 661 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  56.78 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  51.92 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 		 546 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  51.34 
 
 		 565 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  49.16 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.43 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  51.11 
 
 		 597 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  51.67 
 
 		 563 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  47.28 
 
 		 561 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.53 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  50.26 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  51.44 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  48.04 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  52.44 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 565 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.02 
 
 		 665 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.44 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  50.83 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.53 
 
 		 548 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.84 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.82 
 
 		 597 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.07 
 
 		 546 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  52.25 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  52.25 
 
 		 674 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  48.78 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.39 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.87 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.26 
 
 		 609 aa  422  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  50.19 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.17 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  44.69 
 
 		 549 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  46.69 
 
 		 555 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  45.08 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  43.69 
 
 		 593 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  44.26 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  48.11 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  40.07 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  48.02 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.7 
 
 		 525 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  45.27 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  45.61 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  39.58 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  45.06 
 
 		 586 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  43.22 
 
 		 606 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  44.85 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  43.8 
 
 		 576 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  45.59 
 
 		 537 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  42.16 
 
 		 530 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  46.69 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.39 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.11 
 
 		 616 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  46.8 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  52.87 
 
 		 505 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.15 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 593 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.04 
 
 		 531 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.62 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.17 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  46.99 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  46.38 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  44.23 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.4 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  47.5 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  45.13 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 		 548 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.88 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.9 
 
 		 531 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.51 
 
 		 599 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  44.9 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.24 
 
 		 619 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  47.11 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.44 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  45.21 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  47.11 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  45.56 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  44.83 
 
 		 613 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  43.72 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  43.92 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  44.55 
 
 		 536 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  44.76 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.55 
 
 		 530 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>