More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2194 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  65.85 
 
 
573 aa  700    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  56.97 
 
 
643 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  60.03 
 
 
571 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  59.29 
 
 
573 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  100 
 
 
600 aa  1159    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  58.81 
 
 
588 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  58.08 
 
 
594 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  58.73 
 
 
548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  55.4 
 
 
541 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.59 
 
 
584 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  63.95 
 
 
665 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.17 
 
 
661 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  51.83 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.24 
 
 
674 aa  511  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  58.19 
 
 
669 aa  501  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  53.98 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  50 
 
 
619 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  47.17 
 
 
558 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  46.81 
 
 
546 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  47.01 
 
 
575 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  43.95 
 
 
606 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.85 
 
 
549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.58 
 
 
615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  46.39 
 
 
597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  45.29 
 
 
561 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.63 
 
 
616 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  49.3 
 
 
575 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.36 
 
 
575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  46.09 
 
 
593 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  49.82 
 
 
563 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
609 aa  445  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  51.92 
 
 
528 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
620 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.96 
 
 
583 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.85 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.77 
 
 
546 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.95 
 
 
548 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.94 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.26 
 
 
611 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
565 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  44.23 
 
 
576 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42 
 
 
617 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
546 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  46.19 
 
 
606 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.53 
 
 
609 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.04 
 
 
586 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  44.95 
 
 
547 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.4 
 
 
596 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  43.92 
 
 
566 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 
547 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.59 
 
 
609 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
554 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  40.39 
 
 
571 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  49.29 
 
 
545 aa  432  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 
695 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  43.99 
 
 
586 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
571 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47 
 
 
597 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 
571 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.59 
 
 
583 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  39.86 
 
 
566 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
674 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
593 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.07 
 
 
564 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  47.08 
 
 
542 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  44.01 
 
 
597 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  46.21 
 
 
597 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.03 
 
 
619 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.11 
 
 
612 aa  429  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.98 
 
 
562 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.93 
 
 
712 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  46.29 
 
 
603 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.56 
 
 
611 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
539 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
623 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  44.02 
 
 
579 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  43.11 
 
 
569 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  47.45 
 
 
536 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.21 
 
 
578 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  43.01 
 
 
623 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.43 
 
 
623 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  46.8 
 
 
534 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 
637 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.64 
 
 
624 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 
548 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  38.01 
 
 
564 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.97 
 
 
699 aa  422  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.09 
 
 
610 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
633 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.73 
 
 
611 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 
703 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.8 
 
 
611 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.59 
 
 
599 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
607 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
601 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  46.02 
 
 
592 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  43.68 
 
 
552 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  40.95 
 
 
605 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  44.49 
 
 
550 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>