More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5637 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.06 
 
 		 614 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  63.13 
 
 		 613 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  64.06 
 
 		 613 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.85 
 
 		 611 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  100 
 
 		 550 aa  1107    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  61.61 
 
 		 613 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  69.58 
 
 		 608 aa  747    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  79.1 
 
 		 546 aa  829    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  61.52 
 
 		 614 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  58.39 
 
 		 665 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  61.35 
 
 		 621 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  61.16 
 
 		 624 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.89 
 
 		 582 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  59.7 
 
 		 624 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  59.7 
 
 		 624 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  59.51 
 
 		 624 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  57.66 
 
 		 603 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  57.41 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  56.37 
 
 		 551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  56.78 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  57.92 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.43 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  56.09 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  51.65 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  51.65 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  48.13 
 
 		 551 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  51.26 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  48.85 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  48.83 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  48.16 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  48.64 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  48.78 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.67 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  48.21 
 
 		 538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  50.87 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.91 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  40.82 
 
 		 538 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  37.66 
 
 		 547 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  41.11 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  39.12 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.08 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.27 
 
 		 532 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  38.72 
 
 		 566 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.29 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  41.25 
 
 		 540 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 867 aa  345  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.33 
 
 		 566 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  36.79 
 
 		 522 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  36.94 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.49 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  35.66 
 
 		 619 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  37.03 
 
 		 606 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 		 594 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 562 aa  339  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  37.68 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  39.96 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.9 
 
 		 568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.45 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  41.51 
 
 		 547 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  36.64 
 
 		 611 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  37.36 
 
 		 573 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  38.64 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  38.64 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  39.56 
 
 		 548 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  38.24 
 
 		 540 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  38.64 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.13 
 
 		 583 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  38.53 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  40.72 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  38.5 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  36.82 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  38.67 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.86 
 
 		 534 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  37.24 
 
 		 603 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  36.36 
 
 		 588 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.41 
 
 		 558 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  40.15 
 
 		 534 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  38.48 
 
 		 527 aa  332  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  37.68 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  38.98 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.63 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  40.53 
 
 		 592 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.85 
 
 		 531 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 		 568 aa  330  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  38.1 
 
 		 619 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.34 
 
 		 592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.78 
 
 		 555 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35 
 
 		 596 aa  329  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.33 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  37.11 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  36.82 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>