More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1498 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 
613 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  60.47 
 
 
613 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.33 
 
 
582 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  81.91 
 
 
611 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  60.13 
 
 
608 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  95.93 
 
 
614 aa  1172    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  100 
 
 
614 aa  1225    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  60.38 
 
 
665 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  62.46 
 
 
621 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  60.23 
 
 
613 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  61.7 
 
 
624 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  62.52 
 
 
624 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  61.75 
 
 
624 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  61.54 
 
 
624 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  62.62 
 
 
546 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  61.52 
 
 
550 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  54.49 
 
 
603 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  57.54 
 
 
551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.64 
 
 
553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  57.22 
 
 
551 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  57.36 
 
 
557 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  56.56 
 
 
551 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  55.6 
 
 
553 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  50.37 
 
 
540 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  50.19 
 
 
540 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  49.82 
 
 
543 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  50 
 
 
543 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  49.63 
 
 
540 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.88 
 
 
551 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  49.82 
 
 
543 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  48.51 
 
 
551 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  47.43 
 
 
545 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  48.61 
 
 
538 aa  475  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  48.07 
 
 
535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.72 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.07 
 
 
531 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  39.15 
 
 
573 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  39.04 
 
 
583 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.22 
 
 
532 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 
594 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  38.43 
 
 
565 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  38.51 
 
 
561 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  43.74 
 
 
545 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.75 
 
 
568 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.19 
 
 
566 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
565 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.65 
 
 
543 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
557 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  39.65 
 
 
543 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.65 
 
 
543 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 
535 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
524 aa  350  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  37.34 
 
 
572 aa  349  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 
623 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  38.31 
 
 
576 aa  347  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  35.84 
 
 
606 aa  347  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.66 
 
 
546 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.84 
 
 
563 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.14 
 
 
575 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
867 aa  345  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
623 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  39.04 
 
 
546 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
623 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.64 
 
 
570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.33 
 
 
532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.22 
 
 
558 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
602 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.19 
 
 
549 aa  343  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.66 
 
 
593 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.1 
 
 
549 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 
623 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.46 
 
 
619 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  35.46 
 
 
522 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
546 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 
623 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  40.33 
 
 
548 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.68 
 
 
578 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  39.27 
 
 
536 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.71 
 
 
575 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  37.63 
 
 
586 aa  339  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 
609 aa  339  8e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.02 
 
 
596 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.82 
 
 
592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  41.01 
 
 
592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  35.77 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  40.82 
 
 
592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 
539 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.3 
 
 
536 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.58 
 
 
564 aa  336  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
544 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  37 
 
 
547 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
607 aa  335  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.19 
 
 
565 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  35.52 
 
 
583 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  37.46 
 
 
579 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  38.68 
 
 
557 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  39.62 
 
 
571 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
563 aa  333  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.9 
 
 
531 aa  333  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>