More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6357 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  61.79 
 
 		 614 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 		 613 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  58.54 
 
 		 613 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  60.45 
 
 		 613 aa  735    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.14 
 
 		 582 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  61.63 
 
 		 608 aa  705    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.85 
 
 		 611 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  62.52 
 
 		 614 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  77.64 
 
 		 665 aa  938    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  91.68 
 
 		 624 aa  1120    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  56.35 
 
 		 603 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  91.84 
 
 		 624 aa  1121    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  97.1 
 
 		 621 aa  1189    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  100 
 
 		 624 aa  1252    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  92 
 
 		 624 aa  1123    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  62.43 
 
 		 546 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  59.51 
 
 		 551 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  58.88 
 
 		 551 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  61.16 
 
 		 550 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.62 
 
 		 552 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.72 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  59.25 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  60.07 
 
 		 557 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  59.14 
 
 		 551 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  48.26 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  49.54 
 
 		 543 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  49.17 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.33 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  49.81 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  49.26 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.62 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.5 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.54 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.25 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  47.78 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  48.55 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  44.42 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  41.45 
 
 		 566 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.55 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 524 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 539 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.03 
 
 		 532 aa  362  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 669 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.48 
 
 		 568 aa  359  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  40.7 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  40.7 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  40.7 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  39.04 
 
 		 603 aa  359  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  36.49 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.82 
 
 		 593 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  40.8 
 
 		 538 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 518 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.43 
 
 		 536 aa  357  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  38.46 
 
 		 562 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  40.31 
 
 		 532 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.04 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.68 
 
 		 619 aa  353  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.53 
 
 		 534 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  39.4 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  39.82 
 
 		 548 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  39.7 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.41 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  39.11 
 
 		 546 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 623 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  39.85 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.99 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  39.82 
 
 		 539 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  39.22 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  40.52 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 565 aa  348  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  37.45 
 
 		 547 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.73 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  41.38 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  38.17 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  37.79 
 
 		 576 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  37.14 
 
 		 623 aa  347  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  36.35 
 
 		 575 aa  347  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  39.08 
 
 		 557 aa  347  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5689  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 		 696 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34468  normal  0.261455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.34 
 
 		 531 aa  346  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  41.02 
 
 		 565 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.65 
 
 		 540 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.5 
 
 		 561 aa  346  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  39.69 
 
 		 557 aa  346  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 602 aa  346  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  39.66 
 
 		 538 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  41.92 
 
 		 592 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  34.51 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.32 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  39.69 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  41.87 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.6 
 
 		 590 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>