More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3071 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 613 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  60.57 
 
 		 613 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  61.61 
 
 		 550 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  62.25 
 
 		 621 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  56.35 
 
 		 582 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1260    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  59.1 
 
 		 608 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  63.26 
 
 		 624 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  60.23 
 
 		 614 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.48 
 
 		 611 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  61.6 
 
 		 665 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  63.09 
 
 		 624 aa  730    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  61.04 
 
 		 614 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  60.39 
 
 		 624 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  63.09 
 
 		 624 aa  730    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  62 
 
 		 546 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.23 
 
 		 553 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  51.34 
 
 		 603 aa  605  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.46 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  54.01 
 
 		 551 aa  592  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  54.01 
 
 		 551 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  55.11 
 
 		 551 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  54.06 
 
 		 557 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  53.24 
 
 		 553 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.24 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  48.51 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  47.96 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  48.87 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  50.1 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  49.04 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.2 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  47.83 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  48.33 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  50.49 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  47.07 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  46.28 
 
 		 530 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.02 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.68 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.2 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  40 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 602 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.52 
 
 		 561 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  38.69 
 
 		 603 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.02 
 
 		 546 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  38.17 
 
 		 560 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.09 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.21 
 
 		 593 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  37.76 
 
 		 546 aa  360  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.37 
 
 		 565 aa  359  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  37.35 
 
 		 522 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  35.59 
 
 		 565 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.29 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 565 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  38.1 
 
 		 538 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.57 
 
 		 545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  37.6 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  36.95 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.68 
 
 		 586 aa  356  8.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.7 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.92 
 
 		 538 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  38.97 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.68 
 
 		 578 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.12 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  35.84 
 
 		 564 aa  354  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  38.75 
 
 		 571 aa  353  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  37.94 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  38.78 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  37.85 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 543 aa  352  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.92 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  37.98 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.25 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  36.19 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.78 
 
 		 610 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  37.03 
 
 		 534 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.86 
 
 		 577 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  39.35 
 
 		 545 aa  350  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.51 
 
 		 573 aa  350  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  36.82 
 
 		 613 aa  349  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.3 
 
 		 572 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.55 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.28 
 
 		 597 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  37.69 
 
 		 548 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  37.96 
 
 		 550 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 563 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  39.35 
 
 		 541 aa  346  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.78 
 
 		 575 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  35.96 
 
 		 566 aa  346  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  35.2 
 
 		 553 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  36.54 
 
 		 552 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  38.62 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  36.88 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>