More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3520 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 		 540 aa  1070    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  99.26 
 
 		 540 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  92.96 
 
 		 540 aa  995    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  55.74 
 
 		 551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  55.2 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  55.74 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  54.65 
 
 		 543 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  55.77 
 
 		 538 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  53.35 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  53.01 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  51.29 
 
 		 545 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 		 611 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.09 
 
 		 613 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  54.36 
 
 		 530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 		 614 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  51.26 
 
 		 550 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 		 614 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  48.2 
 
 		 613 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.35 
 
 		 613 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  49.81 
 
 		 608 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.13 
 
 		 553 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.26 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.2 
 
 		 665 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  51.07 
 
 		 531 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  48.41 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  48.31 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  48.88 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  48.13 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  47.99 
 
 		 624 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  48.43 
 
 		 621 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  48.17 
 
 		 624 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  48.25 
 
 		 624 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  47.99 
 
 		 624 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  49.26 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  45.83 
 
 		 603 aa  465  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.48 
 
 		 582 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.38 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  41.25 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.43 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  36.62 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  41.84 
 
 		 557 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  36.56 
 
 		 564 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.71 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  40.83 
 
 		 543 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  40.04 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  40.83 
 
 		 543 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  40.83 
 
 		 543 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 609 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  41.65 
 
 		 557 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  40.93 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  39.79 
 
 		 640 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  39.53 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  42.94 
 
 		 566 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.57 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  41.81 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.22 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  40.27 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  41.78 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  37.54 
 
 		 565 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.49 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  37.84 
 
 		 586 aa  360  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  39.21 
 
 		 541 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  40.15 
 
 		 539 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 573 aa  359  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  39.23 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  35.58 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  41.32 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  39.18 
 
 		 575 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.23 
 
 		 627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  39.57 
 
 		 623 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  39 
 
 		 623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.18 
 
 		 576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  39.75 
 
 		 619 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  39.33 
 
 		 549 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  39.21 
 
 		 555 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.49 
 
 		 584 aa  355  8.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  41.86 
 
 		 547 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 524 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  39.11 
 
 		 624 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  42.99 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.02 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  41.09 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  39.07 
 
 		 552 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.15 
 
 		 531 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  38.23 
 
 		 546 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  37.45 
 
 		 543 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.89 
 
 		 570 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.16 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.59 
 
 		 545 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  34.81 
 
 		 571 aa  353  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 602 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  37.11 
 
 		 583 aa  352  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.65 
 
 		 571 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  39.11 
 
 		 554 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>