More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3716 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 524 aa  1040    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  57.44 
 
 		 565 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.65 
 
 		 562 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  43.32 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  43.18 
 
 		 544 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  41.57 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  42.99 
 
 		 576 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  39.82 
 
 		 572 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  44.14 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  45.07 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  38.94 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  45.35 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  38.41 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  41.76 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  45.35 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.75 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  38.66 
 
 		 593 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  45.35 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  46.18 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  38.92 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  38.89 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  42.75 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  42.75 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  40.18 
 
 		 597 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  43.9 
 
 		 527 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  42.75 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  39.04 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  36.85 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.71 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  36.64 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 530 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  41.72 
 
 		 544 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  42.86 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  39.68 
 
 		 640 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  39.5 
 
 		 624 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.15 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  42.35 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.12 
 
 		 564 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  41.59 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  42.35 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.82 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  42.35 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.25 
 
 		 534 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  41.73 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  42.6 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  42.67 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  40.55 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 553 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  41.51 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.18 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.93 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  41.89 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.73 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  41.51 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  40.97 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  41.52 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  42.35 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  38.92 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.04 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  42.35 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  38.33 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  39.39 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  41.62 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.95 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  43.51 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.43 
 
 		 617 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  41.88 
 
 		 545 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  40.15 
 
 		 582 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  44.03 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.72 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  40.21 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  42.16 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  42.66 
 
 		 608 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  42.21 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  40.21 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  38.42 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  40.88 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  42.36 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 		 633 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.75 
 
 		 619 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.26 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  43.33 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 623 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  40.99 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>