More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3743 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  100 
 
 
531 aa  1069    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  51.77 
 
 
543 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  51.2 
 
 
543 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  52.04 
 
 
545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  51.39 
 
 
543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  51.7 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  52.26 
 
 
551 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  51.75 
 
 
540 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  51.36 
 
 
551 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  51.27 
 
 
540 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  51.07 
 
 
540 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  50.84 
 
 
530 aa  475  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  49.72 
 
 
538 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.94 
 
 
613 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  45.02 
 
 
613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  45.91 
 
 
550 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  47.05 
 
 
608 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
614 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  46.73 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
611 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  47.12 
 
 
603 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  46.13 
 
 
551 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.78 
 
 
553 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  45.47 
 
 
551 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
614 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  45.05 
 
 
553 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 
552 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.82 
 
 
582 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  45.57 
 
 
665 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  45.03 
 
 
624 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  44.42 
 
 
624 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  44.61 
 
 
621 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  44.84 
 
 
624 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  44.84 
 
 
624 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  45.13 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  44.96 
 
 
557 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.19 
 
 
532 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.37 
 
 
547 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.59 
 
 
590 aa  362  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  40.89 
 
 
563 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  41.05 
 
 
553 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  39.15 
 
 
555 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
548 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
548 aa  360  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  39.73 
 
 
555 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.76 
 
 
578 aa  359  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  41.02 
 
 
550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  37.06 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  39.05 
 
 
556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.35 
 
 
555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 
557 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  40.23 
 
 
543 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.56 
 
 
564 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  39.56 
 
 
562 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.62 
 
 
619 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  39.61 
 
 
543 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  39.78 
 
 
539 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.15 
 
 
568 aa  352  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  42.86 
 
 
534 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 
535 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  40.68 
 
 
532 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  40.35 
 
 
568 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
573 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  40.67 
 
 
550 aa  350  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  40.3 
 
 
552 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  39.68 
 
 
551 aa  349  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.55 
 
 
531 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  39.66 
 
 
532 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  40.82 
 
 
543 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  40.82 
 
 
543 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  40.82 
 
 
543 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.1 
 
 
583 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  40.67 
 
 
555 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
539 aa  346  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 
594 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 
524 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.77 
 
 
619 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 
559 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.26 
 
 
539 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
540 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  40.08 
 
 
557 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  42.21 
 
 
545 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  34.93 
 
 
571 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  39.26 
 
 
539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  39.77 
 
 
531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  39.06 
 
 
539 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  38.39 
 
 
534 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  38.32 
 
 
557 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.21 
 
 
612 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  35.17 
 
 
564 aa  343  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.32 
 
 
584 aa  343  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  39.88 
 
 
539 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  40.41 
 
 
540 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 
539 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.87 
 
 
549 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  34.93 
 
 
571 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.77 
 
 
561 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  38.86 
 
 
555 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
546 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>