More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5040 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  75.94 
 
 		 557 aa  863    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  100 
 
 		 557 aa  1115    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.82 
 
 		 564 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.27 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  41.43 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.21 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  42.81 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  43.19 
 
 		 565 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.56 
 
 		 555 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  41.54 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  41.18 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.07 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  42.7 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  39.6 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.4 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  40.65 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  41.3 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  39.36 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.49 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  40.68 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.68 
 
 		 612 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  40 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.06 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.6 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  39.11 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  39.24 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 563 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  39.08 
 
 		 611 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.97 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  40.97 
 
 		 542 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.25 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.68 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.78 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 564 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.57 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  39.34 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  41.05 
 
 		 552 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  40.81 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  38.53 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  39.96 
 
 		 595 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.23 
 
 		 617 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  37.63 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.44 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  38.32 
 
 		 610 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.05 
 
 		 616 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  41.62 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  41.44 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.84 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  39.1 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.61 
 
 		 613 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.83 
 
 		 615 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  39.82 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  37.18 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  39.03 
 
 		 569 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  37.18 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.77 
 
 		 575 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.29 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  39.49 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.14 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  40.92 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  39.06 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  38.21 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.08 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  39.04 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.04 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  38.6 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.91 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  39.23 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  38.17 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  39.63 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.66 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  38.49 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  39.07 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.03 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  38.04 
 
 		 532 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  40.47 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 620 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  39.57 
 
 		 599 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  40.07 
 
 		 570 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  37.37 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  40 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  38.32 
 
 		 548 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  39.45 
 
 		 552 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  37.5 
 
 		 624 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.84 
 
 		 592 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>