More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3606 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  100 
 
 
566 aa  1122    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  78.36 
 
 
562 aa  858    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  77.62 
 
 
569 aa  858    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  85.79 
 
 
563 aa  926    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  54.71 
 
 
547 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  54.63 
 
 
631 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  53.01 
 
 
536 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  53.35 
 
 
559 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  50 
 
 
543 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  52.98 
 
 
559 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  52.98 
 
 
559 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
534 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  51.91 
 
 
579 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 
582 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  52.91 
 
 
594 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  47.27 
 
 
562 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.95 
 
 
605 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  48.55 
 
 
550 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.98 
 
 
516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.06 
 
 
565 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.61 
 
 
586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.72 
 
 
593 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  44.48 
 
 
555 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
543 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  44.7 
 
 
555 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
573 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.14 
 
 
571 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  46.43 
 
 
540 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  47.72 
 
 
551 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  43.83 
 
 
571 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
623 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  45.54 
 
 
540 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
593 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
541 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
623 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
544 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.12 
 
 
555 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.03 
 
 
643 aa  432  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.05 
 
 
571 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.05 
 
 
623 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  44.78 
 
 
544 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.92 
 
 
583 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  45.65 
 
 
540 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
571 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  41.58 
 
 
576 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
540 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  43.63 
 
 
556 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  45.36 
 
 
540 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
623 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  45.65 
 
 
540 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  45.36 
 
 
540 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  41.17 
 
 
530 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
539 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.83 
 
 
623 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 
623 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.78 
 
 
573 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  45.65 
 
 
549 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
623 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 
623 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.53 
 
 
599 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  44.68 
 
 
588 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.39 
 
 
609 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  44.54 
 
 
558 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  41.17 
 
 
530 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.4 
 
 
661 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.03 
 
 
575 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  44.48 
 
 
599 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.83 
 
 
623 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  40.64 
 
 
619 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.43 
 
 
571 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
547 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
620 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  43.09 
 
 
629 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  42.98 
 
 
600 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  41.79 
 
 
549 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  41.14 
 
 
566 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  41.91 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.13 
 
 
572 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 
549 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.51 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.4 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  42.7 
 
 
593 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.45 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.55 
 
 
584 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  45.07 
 
 
545 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
551 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
549 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  43.23 
 
 
619 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
623 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  44.48 
 
 
555 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
549 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  44.14 
 
 
539 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.18 
 
 
616 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  41.73 
 
 
611 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  44.89 
 
 
545 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  44.08 
 
 
539 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
549 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
623 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
549 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  43.77 
 
 
539 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>